Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE4

SMPD4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, humanhuman

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD4Q9NXE4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms