Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ7

GFRA4, GDNF family receptor alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA4Q9GZZ7 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GFRA4Q9GZZ7 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GFRA4Q9GZZ7 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms