Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLIRPQ9GZT3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLIRPQ9GZT3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLIRPQ9GZT3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLIRPQ9GZT3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLIRPQ9GZT3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLIRPQ9GZT3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLIRPQ9GZT3 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLIRPQ9GZT3 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLIRPQ9GZT3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLIRPQ9GZT3 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLIRPQ9GZT3 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLIRPQ9GZT3 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLIRPQ9GZT3 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLIRPQ9GZT3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLIRPQ9GZT3 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLIRPQ9GZT3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLIRPQ9GZT3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLIRPQ9GZT3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLIRPQ9GZT3 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLIRPQ9GZT3 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLIRPQ9GZT3 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLIRPQ9GZT3 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLIRPQ9GZT3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLIRPQ9GZT3 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLIRPQ9GZT3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLIRPQ9GZT3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLIRPQ9GZT3 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLIRPQ9GZT3 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLIRPQ9GZT3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLIRPQ9GZT3 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLIRPQ9GZT3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLIRPQ9GZT3 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLIRPQ9GZT3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLIRPQ9GZT3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLIRPQ9GZT3 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLIRPQ9GZT3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLIRPQ9GZT3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLIRPQ9GZT3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLIRPQ9GZT3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SLIRPQ9GZT3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLIRPQ9GZT3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLIRPQ9GZT3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLIRPQ9GZT3 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLIRPQ9GZT3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLIRPQ9GZT3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLIRPQ9GZT3 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLIRPQ9GZT3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLIRPQ9GZT3 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLIRPQ9GZT3 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLIRPQ9GZT3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SLIRPQ9GZT3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLIRPQ9GZT3 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLIRPQ9GZT3 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLIRPQ9GZT3 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLIRPQ9GZT3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLIRPQ9GZT3 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLIRPQ9GZT3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLIRPQ9GZT3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLIRPQ9GZT3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLIRPQ9GZT3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLIRPQ9GZT3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLIRPQ9GZT3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLIRPQ9GZT3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLIRPQ9GZT3 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLIRPQ9GZT3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLIRPQ9GZT3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLIRPQ9GZT3 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLIRPQ9GZT3 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLIRPQ9GZT3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLIRPQ9GZT3 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLIRPQ9GZT3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLIRPQ9GZT3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLIRPQ9GZT3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLIRPQ9GZT3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLIRPQ9GZT3 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLIRPQ9GZT3 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLIRPQ9GZT3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SLIRPQ9GZT3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLIRPQ9GZT3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLIRPQ9GZT3 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLIRPQ9GZT3 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLIRPQ9GZT3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLIRPQ9GZT3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLIRPQ9GZT3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLIRPQ9GZT3 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLIRPQ9GZT3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLIRPQ9GZT3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLIRPQ9GZT3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLIRPQ9GZT3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SLIRPQ9GZT3 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLIRPQ9GZT3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLIRPQ9GZT3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLIRPQ9GZT3 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLIRPQ9GZT3 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLIRPQ9GZT3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLIRPQ9GZT3 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLIRPQ9GZT3 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SLIRPQ9GZT3 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLIRPQ9GZT3 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms