Protein–RNA interactions for Protein: Q9C098

DCLK3, Serine/threonine-protein kinase DCLK3, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLK3Q9C098 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCLK3Q9C098 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCLK3Q9C098 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCLK3Q9C098 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
DCLK3Q9C098 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DCLK3Q9C098 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DCLK3Q9C098 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DCLK3Q9C098 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DCLK3Q9C098 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DCLK3Q9C098 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DCLK3Q9C098 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DCLK3Q9C098 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DCLK3Q9C098 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DCLK3Q9C098 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DCLK3Q9C098 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DCLK3Q9C098 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DCLK3Q9C098 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DCLK3Q9C098 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DCLK3Q9C098 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DCLK3Q9C098 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCLK3Q9C098 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCLK3Q9C098 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCLK3Q9C098 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCLK3Q9C098 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCLK3Q9C098 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCLK3Q9C098 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCLK3Q9C098 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCLK3Q9C098 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCLK3Q9C098 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCLK3Q9C098 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCLK3Q9C098 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCLK3Q9C098 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCLK3Q9C098 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCLK3Q9C098 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCLK3Q9C098 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
DCLK3Q9C098 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCLK3Q9C098 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCLK3Q9C098 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCLK3Q9C098 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCLK3Q9C098 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCLK3Q9C098 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCLK3Q9C098 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCLK3Q9C098 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCLK3Q9C098 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCLK3Q9C098 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCLK3Q9C098 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCLK3Q9C098 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCLK3Q9C098 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCLK3Q9C098 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCLK3Q9C098 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCLK3Q9C098 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCLK3Q9C098 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCLK3Q9C098 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCLK3Q9C098 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCLK3Q9C098 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCLK3Q9C098 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCLK3Q9C098 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCLK3Q9C098 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCLK3Q9C098 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DCLK3Q9C098 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCLK3Q9C098 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCLK3Q9C098 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCLK3Q9C098 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCLK3Q9C098 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCLK3Q9C098 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCLK3Q9C098 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCLK3Q9C098 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCLK3Q9C098 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCLK3Q9C098 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCLK3Q9C098 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCLK3Q9C098 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCLK3Q9C098 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCLK3Q9C098 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCLK3Q9C098 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCLK3Q9C098 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCLK3Q9C098 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCLK3Q9C098 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DCLK3Q9C098 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DCLK3Q9C098 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DCLK3Q9C098 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DCLK3Q9C098 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DCLK3Q9C098 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DCLK3Q9C098 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCLK3Q9C098 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCLK3Q9C098 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCLK3Q9C098 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCLK3Q9C098 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCLK3Q9C098 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCLK3Q9C098 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCLK3Q9C098 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCLK3Q9C098 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCLK3Q9C098 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCLK3Q9C098 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCLK3Q9C098 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCLK3Q9C098 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCLK3Q9C098 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCLK3Q9C098 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCLK3Q9C098 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCLK3Q9C098 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCLK3Q9C098 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms