Protein–RNA interactions for Protein: Q9C002

NMES1, Normal mucosa of esophagus-specific gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMES1Q9C002 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NMES1Q9C002 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NMES1Q9C002 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
NMES1Q9C002 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
NMES1Q9C002 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NMES1Q9C002 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NMES1Q9C002 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NMES1Q9C002 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NMES1Q9C002 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NMES1Q9C002 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NMES1Q9C002 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NMES1Q9C002 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NMES1Q9C002 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NMES1Q9C002 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NMES1Q9C002 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NMES1Q9C002 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NMES1Q9C002 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NMES1Q9C002 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NMES1Q9C002 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NMES1Q9C002 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NMES1Q9C002 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NMES1Q9C002 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NMES1Q9C002 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NMES1Q9C002 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NMES1Q9C002 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NMES1Q9C002 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NMES1Q9C002 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NMES1Q9C002 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NMES1Q9C002 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NMES1Q9C002 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NMES1Q9C002 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NMES1Q9C002 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NMES1Q9C002 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NMES1Q9C002 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NMES1Q9C002 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NMES1Q9C002 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NMES1Q9C002 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NMES1Q9C002 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NMES1Q9C002 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NMES1Q9C002 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NMES1Q9C002 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NMES1Q9C002 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NMES1Q9C002 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NMES1Q9C002 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NMES1Q9C002 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NMES1Q9C002 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NMES1Q9C002 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NMES1Q9C002 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NMES1Q9C002 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NMES1Q9C002 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NMES1Q9C002 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NMES1Q9C002 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NMES1Q9C002 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NMES1Q9C002 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NMES1Q9C002 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NMES1Q9C002 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NMES1Q9C002 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NMES1Q9C002 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NMES1Q9C002 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NMES1Q9C002 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NMES1Q9C002 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NMES1Q9C002 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NMES1Q9C002 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NMES1Q9C002 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NMES1Q9C002 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NMES1Q9C002 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NMES1Q9C002 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NMES1Q9C002 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NMES1Q9C002 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NMES1Q9C002 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NMES1Q9C002 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NMES1Q9C002 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NMES1Q9C002 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NMES1Q9C002 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NMES1Q9C002 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NMES1Q9C002 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NMES1Q9C002 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NMES1Q9C002 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NMES1Q9C002 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NMES1Q9C002 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NMES1Q9C002 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NMES1Q9C002 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NMES1Q9C002 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NMES1Q9C002 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NMES1Q9C002 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NMES1Q9C002 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NMES1Q9C002 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NMES1Q9C002 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NMES1Q9C002 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NMES1Q9C002 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NMES1Q9C002 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NMES1Q9C002 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NMES1Q9C002 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NMES1Q9C002 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NMES1Q9C002 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NMES1Q9C002 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NMES1Q9C002 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NMES1Q9C002 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NMES1Q9C002 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NMES1Q9C002 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms