Protein–RNA interactions for Protein: Q96N95

ZNF396, Zinc finger protein 396, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF396Q96N95 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF396Q96N95 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF396Q96N95 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF396Q96N95 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF396Q96N95 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF396Q96N95 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF396Q96N95 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF396Q96N95 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF396Q96N95 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF396Q96N95 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF396Q96N95 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF396Q96N95 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF396Q96N95 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF396Q96N95 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF396Q96N95 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF396Q96N95 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF396Q96N95 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF396Q96N95 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF396Q96N95 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF396Q96N95 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF396Q96N95 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF396Q96N95 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF396Q96N95 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF396Q96N95 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF396Q96N95 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF396Q96N95 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF396Q96N95 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF396Q96N95 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF396Q96N95 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF396Q96N95 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF396Q96N95 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF396Q96N95 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF396Q96N95 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF396Q96N95 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF396Q96N95 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF396Q96N95 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF396Q96N95 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF396Q96N95 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF396Q96N95 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ZNF396Q96N95 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF396Q96N95 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF396Q96N95 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF396Q96N95 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF396Q96N95 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF396Q96N95 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF396Q96N95 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF396Q96N95 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF396Q96N95 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF396Q96N95 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF396Q96N95 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF396Q96N95 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF396Q96N95 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF396Q96N95 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF396Q96N95 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF396Q96N95 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF396Q96N95 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF396Q96N95 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF396Q96N95 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF396Q96N95 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF396Q96N95 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF396Q96N95 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF396Q96N95 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF396Q96N95 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF396Q96N95 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF396Q96N95 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF396Q96N95 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF396Q96N95 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF396Q96N95 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF396Q96N95 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF396Q96N95 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF396Q96N95 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF396Q96N95 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF396Q96N95 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF396Q96N95 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF396Q96N95 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF396Q96N95 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF396Q96N95 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF396Q96N95 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF396Q96N95 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF396Q96N95 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF396Q96N95 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF396Q96N95 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF396Q96N95 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF396Q96N95 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF396Q96N95 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF396Q96N95 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF396Q96N95 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF396Q96N95 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF396Q96N95 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF396Q96N95 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF396Q96N95 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF396Q96N95 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF396Q96N95 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF396Q96N95 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF396Q96N95 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF396Q96N95 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF396Q96N95 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF396Q96N95 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF396Q96N95 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF396Q96N95 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms