Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKNOX2Q96KN3 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKNOX2Q96KN3 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKNOX2Q96KN3 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PKNOX2Q96KN3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKNOX2Q96KN3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKNOX2Q96KN3 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PKNOX2Q96KN3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PKNOX2Q96KN3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PKNOX2Q96KN3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PKNOX2Q96KN3 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PKNOX2Q96KN3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PKNOX2Q96KN3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PKNOX2Q96KN3 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PKNOX2Q96KN3 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PKNOX2Q96KN3 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PKNOX2Q96KN3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PKNOX2Q96KN3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PKNOX2Q96KN3 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PKNOX2Q96KN3 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PKNOX2Q96KN3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PKNOX2Q96KN3 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PKNOX2Q96KN3 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PKNOX2Q96KN3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PKNOX2Q96KN3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PKNOX2Q96KN3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PKNOX2Q96KN3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PKNOX2Q96KN3 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PKNOX2Q96KN3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PKNOX2Q96KN3 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PKNOX2Q96KN3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PKNOX2Q96KN3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PKNOX2Q96KN3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PKNOX2Q96KN3 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PKNOX2Q96KN3 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PKNOX2Q96KN3 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PKNOX2Q96KN3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PKNOX2Q96KN3 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PKNOX2Q96KN3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PKNOX2Q96KN3 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PKNOX2Q96KN3 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PKNOX2Q96KN3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PKNOX2Q96KN3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PKNOX2Q96KN3 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PKNOX2Q96KN3 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PKNOX2Q96KN3 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PKNOX2Q96KN3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PKNOX2Q96KN3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PKNOX2Q96KN3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PKNOX2Q96KN3 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PKNOX2Q96KN3 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PKNOX2Q96KN3 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PKNOX2Q96KN3 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PKNOX2Q96KN3 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PKNOX2Q96KN3 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PKNOX2Q96KN3 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PKNOX2Q96KN3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PKNOX2Q96KN3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PKNOX2Q96KN3 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PKNOX2Q96KN3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PKNOX2Q96KN3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PKNOX2Q96KN3 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PKNOX2Q96KN3 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PKNOX2Q96KN3 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PKNOX2Q96KN3 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PKNOX2Q96KN3 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PKNOX2Q96KN3 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PKNOX2Q96KN3 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PKNOX2Q96KN3 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PKNOX2Q96KN3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PKNOX2Q96KN3 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PKNOX2Q96KN3 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PKNOX2Q96KN3 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PKNOX2Q96KN3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PKNOX2Q96KN3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PKNOX2Q96KN3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PKNOX2Q96KN3 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PKNOX2Q96KN3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PKNOX2Q96KN3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PKNOX2Q96KN3 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PKNOX2Q96KN3 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PKNOX2Q96KN3 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKNOX2Q96KN3 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKNOX2Q96KN3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKNOX2Q96KN3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PKNOX2Q96KN3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKNOX2Q96KN3 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKNOX2Q96KN3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKNOX2Q96KN3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKNOX2Q96KN3 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKNOX2Q96KN3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKNOX2Q96KN3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKNOX2Q96KN3 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKNOX2Q96KN3 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKNOX2Q96KN3 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKNOX2Q96KN3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKNOX2Q96KN3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKNOX2Q96KN3 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKNOX2Q96KN3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKNOX2Q96KN3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms