Protein–RNA interactions for Protein: Q96JH7

VCPIP1, Deubiquitinating protein VCIP135, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPIP1Q96JH7 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VCPIP1Q96JH7 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VCPIP1Q96JH7 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VCPIP1Q96JH7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VCPIP1Q96JH7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VCPIP1Q96JH7 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VCPIP1Q96JH7 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VCPIP1Q96JH7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VCPIP1Q96JH7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VCPIP1Q96JH7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VCPIP1Q96JH7 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VCPIP1Q96JH7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VCPIP1Q96JH7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VCPIP1Q96JH7 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VCPIP1Q96JH7 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VCPIP1Q96JH7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VCPIP1Q96JH7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VCPIP1Q96JH7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VCPIP1Q96JH7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VCPIP1Q96JH7 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VCPIP1Q96JH7 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
VCPIP1Q96JH7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VCPIP1Q96JH7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VCPIP1Q96JH7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VCPIP1Q96JH7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VCPIP1Q96JH7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VCPIP1Q96JH7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VCPIP1Q96JH7 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VCPIP1Q96JH7 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VCPIP1Q96JH7 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VCPIP1Q96JH7 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VCPIP1Q96JH7 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
VCPIP1Q96JH7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VCPIP1Q96JH7 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VCPIP1Q96JH7 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VCPIP1Q96JH7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VCPIP1Q96JH7 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VCPIP1Q96JH7 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VCPIP1Q96JH7 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VCPIP1Q96JH7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VCPIP1Q96JH7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VCPIP1Q96JH7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VCPIP1Q96JH7 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VCPIP1Q96JH7 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VCPIP1Q96JH7 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VCPIP1Q96JH7 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VCPIP1Q96JH7 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VCPIP1Q96JH7 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VCPIP1Q96JH7 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VCPIP1Q96JH7 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VCPIP1Q96JH7 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VCPIP1Q96JH7 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VCPIP1Q96JH7 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VCPIP1Q96JH7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VCPIP1Q96JH7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VCPIP1Q96JH7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VCPIP1Q96JH7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
VCPIP1Q96JH7 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VCPIP1Q96JH7 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VCPIP1Q96JH7 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VCPIP1Q96JH7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VCPIP1Q96JH7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
VCPIP1Q96JH7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VCPIP1Q96JH7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VCPIP1Q96JH7 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VCPIP1Q96JH7 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VCPIP1Q96JH7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VCPIP1Q96JH7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VCPIP1Q96JH7 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VCPIP1Q96JH7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VCPIP1Q96JH7 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VCPIP1Q96JH7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VCPIP1Q96JH7 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VCPIP1Q96JH7 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VCPIP1Q96JH7 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VCPIP1Q96JH7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VCPIP1Q96JH7 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VCPIP1Q96JH7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
VCPIP1Q96JH7 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VCPIP1Q96JH7 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VCPIP1Q96JH7 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VCPIP1Q96JH7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VCPIP1Q96JH7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VCPIP1Q96JH7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VCPIP1Q96JH7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VCPIP1Q96JH7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VCPIP1Q96JH7 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VCPIP1Q96JH7 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VCPIP1Q96JH7 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VCPIP1Q96JH7 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VCPIP1Q96JH7 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VCPIP1Q96JH7 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VCPIP1Q96JH7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VCPIP1Q96JH7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VCPIP1Q96JH7 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VCPIP1Q96JH7 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VCPIP1Q96JH7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VCPIP1Q96JH7 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VCPIP1Q96JH7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VCPIP1Q96JH7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms