Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
C18orf8Q96DM3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C18orf8Q96DM3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C18orf8Q96DM3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C18orf8Q96DM3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C18orf8Q96DM3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C18orf8Q96DM3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C18orf8Q96DM3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C18orf8Q96DM3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C18orf8Q96DM3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C18orf8Q96DM3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C18orf8Q96DM3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C18orf8Q96DM3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C18orf8Q96DM3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
C18orf8Q96DM3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C18orf8Q96DM3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C18orf8Q96DM3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C18orf8Q96DM3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C18orf8Q96DM3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C18orf8Q96DM3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C18orf8Q96DM3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C18orf8Q96DM3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C18orf8Q96DM3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C18orf8Q96DM3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C18orf8Q96DM3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C18orf8Q96DM3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C18orf8Q96DM3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C18orf8Q96DM3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C18orf8Q96DM3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
C18orf8Q96DM3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
C18orf8Q96DM3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C18orf8Q96DM3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C18orf8Q96DM3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C18orf8Q96DM3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C18orf8Q96DM3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C18orf8Q96DM3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C18orf8Q96DM3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C18orf8Q96DM3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
C18orf8Q96DM3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C18orf8Q96DM3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C18orf8Q96DM3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C18orf8Q96DM3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C18orf8Q96DM3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C18orf8Q96DM3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C18orf8Q96DM3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C18orf8Q96DM3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
C18orf8Q96DM3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C18orf8Q96DM3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C18orf8Q96DM3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C18orf8Q96DM3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C18orf8Q96DM3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C18orf8Q96DM3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C18orf8Q96DM3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C18orf8Q96DM3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C18orf8Q96DM3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C18orf8Q96DM3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C18orf8Q96DM3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C18orf8Q96DM3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C18orf8Q96DM3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C18orf8Q96DM3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C18orf8Q96DM3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C18orf8Q96DM3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
C18orf8Q96DM3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C18orf8Q96DM3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C18orf8Q96DM3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C18orf8Q96DM3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C18orf8Q96DM3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C18orf8Q96DM3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C18orf8Q96DM3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C18orf8Q96DM3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C18orf8Q96DM3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C18orf8Q96DM3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C18orf8Q96DM3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C18orf8Q96DM3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C18orf8Q96DM3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C18orf8Q96DM3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C18orf8Q96DM3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C18orf8Q96DM3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C18orf8Q96DM3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C18orf8Q96DM3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C18orf8Q96DM3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C18orf8Q96DM3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C18orf8Q96DM3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
C18orf8Q96DM3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C18orf8Q96DM3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C18orf8Q96DM3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C18orf8Q96DM3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C18orf8Q96DM3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C18orf8Q96DM3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C18orf8Q96DM3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C18orf8Q96DM3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C18orf8Q96DM3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
C18orf8Q96DM3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C18orf8Q96DM3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C18orf8Q96DM3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C18orf8Q96DM3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C18orf8Q96DM3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C18orf8Q96DM3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C18orf8Q96DM3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C18orf8Q96DM3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms