Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC3

PYDC1, Pyrin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYDC1Q8WXC3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PYDC1Q8WXC3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PYDC1Q8WXC3 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PYDC1Q8WXC3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PYDC1Q8WXC3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PYDC1Q8WXC3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PYDC1Q8WXC3 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PYDC1Q8WXC3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PYDC1Q8WXC3 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PYDC1Q8WXC3 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PYDC1Q8WXC3 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PYDC1Q8WXC3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PYDC1Q8WXC3 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PYDC1Q8WXC3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PYDC1Q8WXC3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PYDC1Q8WXC3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PYDC1Q8WXC3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PYDC1Q8WXC3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PYDC1Q8WXC3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PYDC1Q8WXC3 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PYDC1Q8WXC3 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PYDC1Q8WXC3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PYDC1Q8WXC3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PYDC1Q8WXC3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PYDC1Q8WXC3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PYDC1Q8WXC3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PYDC1Q8WXC3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PYDC1Q8WXC3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PYDC1Q8WXC3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PYDC1Q8WXC3 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PYDC1Q8WXC3 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PYDC1Q8WXC3 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PYDC1Q8WXC3 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PYDC1Q8WXC3 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PYDC1Q8WXC3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PYDC1Q8WXC3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PYDC1Q8WXC3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PYDC1Q8WXC3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PYDC1Q8WXC3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PYDC1Q8WXC3 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PYDC1Q8WXC3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PYDC1Q8WXC3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PYDC1Q8WXC3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PYDC1Q8WXC3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PYDC1Q8WXC3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PYDC1Q8WXC3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PYDC1Q8WXC3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PYDC1Q8WXC3 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PYDC1Q8WXC3 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PYDC1Q8WXC3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PYDC1Q8WXC3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PYDC1Q8WXC3 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PYDC1Q8WXC3 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PYDC1Q8WXC3 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PYDC1Q8WXC3 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PYDC1Q8WXC3 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PYDC1Q8WXC3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PYDC1Q8WXC3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PYDC1Q8WXC3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PYDC1Q8WXC3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PYDC1Q8WXC3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PYDC1Q8WXC3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PYDC1Q8WXC3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PYDC1Q8WXC3 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PYDC1Q8WXC3 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PYDC1Q8WXC3 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PYDC1Q8WXC3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PYDC1Q8WXC3 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PYDC1Q8WXC3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PYDC1Q8WXC3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PYDC1Q8WXC3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PYDC1Q8WXC3 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PYDC1Q8WXC3 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PYDC1Q8WXC3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PYDC1Q8WXC3 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PYDC1Q8WXC3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PYDC1Q8WXC3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PYDC1Q8WXC3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PYDC1Q8WXC3 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PYDC1Q8WXC3 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PYDC1Q8WXC3 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PYDC1Q8WXC3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PYDC1Q8WXC3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PYDC1Q8WXC3 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PYDC1Q8WXC3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PYDC1Q8WXC3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PYDC1Q8WXC3 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PYDC1Q8WXC3 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PYDC1Q8WXC3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PYDC1Q8WXC3 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PYDC1Q8WXC3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PYDC1Q8WXC3 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PYDC1Q8WXC3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PYDC1Q8WXC3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PYDC1Q8WXC3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PYDC1Q8WXC3 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PYDC1Q8WXC3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PYDC1Q8WXC3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PYDC1Q8WXC3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PYDC1Q8WXC3 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms