Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVJ9

TWIST2, Twist-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST2Q8WVJ9 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TWIST2Q8WVJ9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TWIST2Q8WVJ9 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TWIST2Q8WVJ9 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TWIST2Q8WVJ9 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TWIST2Q8WVJ9 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TWIST2Q8WVJ9 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TWIST2Q8WVJ9 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TWIST2Q8WVJ9 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TWIST2Q8WVJ9 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TWIST2Q8WVJ9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TWIST2Q8WVJ9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TWIST2Q8WVJ9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TWIST2Q8WVJ9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TWIST2Q8WVJ9 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TWIST2Q8WVJ9 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TWIST2Q8WVJ9 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TWIST2Q8WVJ9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TWIST2Q8WVJ9 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TWIST2Q8WVJ9 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TWIST2Q8WVJ9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TWIST2Q8WVJ9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TWIST2Q8WVJ9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TWIST2Q8WVJ9 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TWIST2Q8WVJ9 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TWIST2Q8WVJ9 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TWIST2Q8WVJ9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
TWIST2Q8WVJ9 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TWIST2Q8WVJ9 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TWIST2Q8WVJ9 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TWIST2Q8WVJ9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TWIST2Q8WVJ9 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TWIST2Q8WVJ9 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TWIST2Q8WVJ9 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TWIST2Q8WVJ9 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TWIST2Q8WVJ9 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TWIST2Q8WVJ9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TWIST2Q8WVJ9 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TWIST2Q8WVJ9 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TWIST2Q8WVJ9 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TWIST2Q8WVJ9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TWIST2Q8WVJ9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TWIST2Q8WVJ9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TWIST2Q8WVJ9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TWIST2Q8WVJ9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TWIST2Q8WVJ9 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TWIST2Q8WVJ9 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TWIST2Q8WVJ9 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TWIST2Q8WVJ9 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TWIST2Q8WVJ9 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TWIST2Q8WVJ9 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TWIST2Q8WVJ9 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TWIST2Q8WVJ9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TWIST2Q8WVJ9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TWIST2Q8WVJ9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TWIST2Q8WVJ9 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TWIST2Q8WVJ9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TWIST2Q8WVJ9 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TWIST2Q8WVJ9 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TWIST2Q8WVJ9 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TWIST2Q8WVJ9 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TWIST2Q8WVJ9 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TWIST2Q8WVJ9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TWIST2Q8WVJ9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TWIST2Q8WVJ9 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TWIST2Q8WVJ9 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TWIST2Q8WVJ9 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TWIST2Q8WVJ9 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TWIST2Q8WVJ9 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TWIST2Q8WVJ9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TWIST2Q8WVJ9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TWIST2Q8WVJ9 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TWIST2Q8WVJ9 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TWIST2Q8WVJ9 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TWIST2Q8WVJ9 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TWIST2Q8WVJ9 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TWIST2Q8WVJ9 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TWIST2Q8WVJ9 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TWIST2Q8WVJ9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TWIST2Q8WVJ9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TWIST2Q8WVJ9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TWIST2Q8WVJ9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TWIST2Q8WVJ9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TWIST2Q8WVJ9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TWIST2Q8WVJ9 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TWIST2Q8WVJ9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TWIST2Q8WVJ9 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TWIST2Q8WVJ9 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TWIST2Q8WVJ9 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TWIST2Q8WVJ9 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TWIST2Q8WVJ9 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TWIST2Q8WVJ9 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TWIST2Q8WVJ9 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TWIST2Q8WVJ9 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TWIST2Q8WVJ9 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TWIST2Q8WVJ9 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TWIST2Q8WVJ9 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TWIST2Q8WVJ9 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TWIST2Q8WVJ9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TWIST2Q8WVJ9 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 165.7 ms