Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDF6

RASGRP4, RAS guanyl-releasing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRP4Q8TDF6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RASGRP4Q8TDF6 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RASGRP4Q8TDF6 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RASGRP4Q8TDF6 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RASGRP4Q8TDF6 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RASGRP4Q8TDF6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RASGRP4Q8TDF6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RASGRP4Q8TDF6 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RASGRP4Q8TDF6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RASGRP4Q8TDF6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RASGRP4Q8TDF6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RASGRP4Q8TDF6 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RASGRP4Q8TDF6 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RASGRP4Q8TDF6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RASGRP4Q8TDF6 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RASGRP4Q8TDF6 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RASGRP4Q8TDF6 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RASGRP4Q8TDF6 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RASGRP4Q8TDF6 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RASGRP4Q8TDF6 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RASGRP4Q8TDF6 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RASGRP4Q8TDF6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RASGRP4Q8TDF6 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RASGRP4Q8TDF6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RASGRP4Q8TDF6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RASGRP4Q8TDF6 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RASGRP4Q8TDF6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RASGRP4Q8TDF6 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RASGRP4Q8TDF6 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RASGRP4Q8TDF6 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RASGRP4Q8TDF6 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RASGRP4Q8TDF6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RASGRP4Q8TDF6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RASGRP4Q8TDF6 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RASGRP4Q8TDF6 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RASGRP4Q8TDF6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RASGRP4Q8TDF6 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RASGRP4Q8TDF6 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RASGRP4Q8TDF6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RASGRP4Q8TDF6 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RASGRP4Q8TDF6 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RASGRP4Q8TDF6 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RASGRP4Q8TDF6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RASGRP4Q8TDF6 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RASGRP4Q8TDF6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RASGRP4Q8TDF6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RASGRP4Q8TDF6 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RASGRP4Q8TDF6 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RASGRP4Q8TDF6 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RASGRP4Q8TDF6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RASGRP4Q8TDF6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RASGRP4Q8TDF6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RASGRP4Q8TDF6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RASGRP4Q8TDF6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RASGRP4Q8TDF6 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RASGRP4Q8TDF6 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RASGRP4Q8TDF6 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RASGRP4Q8TDF6 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RASGRP4Q8TDF6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RASGRP4Q8TDF6 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RASGRP4Q8TDF6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RASGRP4Q8TDF6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RASGRP4Q8TDF6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RASGRP4Q8TDF6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RASGRP4Q8TDF6 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RASGRP4Q8TDF6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RASGRP4Q8TDF6 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RASGRP4Q8TDF6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RASGRP4Q8TDF6 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RASGRP4Q8TDF6 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RASGRP4Q8TDF6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RASGRP4Q8TDF6 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RASGRP4Q8TDF6 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RASGRP4Q8TDF6 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RASGRP4Q8TDF6 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RASGRP4Q8TDF6 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RASGRP4Q8TDF6 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RASGRP4Q8TDF6 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RASGRP4Q8TDF6 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RASGRP4Q8TDF6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RASGRP4Q8TDF6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RASGRP4Q8TDF6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RASGRP4Q8TDF6 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RASGRP4Q8TDF6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RASGRP4Q8TDF6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RASGRP4Q8TDF6 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RASGRP4Q8TDF6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RASGRP4Q8TDF6 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RASGRP4Q8TDF6 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RASGRP4Q8TDF6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RASGRP4Q8TDF6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RASGRP4Q8TDF6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RASGRP4Q8TDF6 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RASGRP4Q8TDF6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RASGRP4Q8TDF6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RASGRP4Q8TDF6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RASGRP4Q8TDF6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RASGRP4Q8TDF6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RASGRP4Q8TDF6 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RASGRP4Q8TDF6 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms