Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG06

TRIM58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM58Q8NG06 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM58Q8NG06 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM58Q8NG06 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM58Q8NG06 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM58Q8NG06 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM58Q8NG06 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM58Q8NG06 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM58Q8NG06 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM58Q8NG06 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM58Q8NG06 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM58Q8NG06 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM58Q8NG06 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM58Q8NG06 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM58Q8NG06 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM58Q8NG06 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM58Q8NG06 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM58Q8NG06 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM58Q8NG06 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM58Q8NG06 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM58Q8NG06 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM58Q8NG06 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM58Q8NG06 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM58Q8NG06 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM58Q8NG06 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM58Q8NG06 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM58Q8NG06 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM58Q8NG06 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM58Q8NG06 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM58Q8NG06 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM58Q8NG06 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM58Q8NG06 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM58Q8NG06 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM58Q8NG06 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM58Q8NG06 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM58Q8NG06 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM58Q8NG06 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM58Q8NG06 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM58Q8NG06 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM58Q8NG06 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM58Q8NG06 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM58Q8NG06 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM58Q8NG06 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM58Q8NG06 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM58Q8NG06 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM58Q8NG06 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM58Q8NG06 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM58Q8NG06 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM58Q8NG06 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM58Q8NG06 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM58Q8NG06 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM58Q8NG06 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM58Q8NG06 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM58Q8NG06 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM58Q8NG06 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM58Q8NG06 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM58Q8NG06 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM58Q8NG06 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM58Q8NG06 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM58Q8NG06 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM58Q8NG06 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM58Q8NG06 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM58Q8NG06 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM58Q8NG06 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM58Q8NG06 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM58Q8NG06 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM58Q8NG06 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM58Q8NG06 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM58Q8NG06 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM58Q8NG06 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM58Q8NG06 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM58Q8NG06 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM58Q8NG06 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM58Q8NG06 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM58Q8NG06 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM58Q8NG06 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRIM58Q8NG06 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRIM58Q8NG06 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRIM58Q8NG06 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM58Q8NG06 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM58Q8NG06 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM58Q8NG06 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM58Q8NG06 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM58Q8NG06 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM58Q8NG06 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM58Q8NG06 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM58Q8NG06 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM58Q8NG06 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM58Q8NG06 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM58Q8NG06 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM58Q8NG06 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM58Q8NG06 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM58Q8NG06 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM58Q8NG06 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM58Q8NG06 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM58Q8NG06 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM58Q8NG06 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM58Q8NG06 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM58Q8NG06 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM58Q8NG06 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM58Q8NG06 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms