Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LINC00301Q8NCQ3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LINC00301Q8NCQ3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LINC00301Q8NCQ3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LINC00301Q8NCQ3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LINC00301Q8NCQ3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LINC00301Q8NCQ3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LINC00301Q8NCQ3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LINC00301Q8NCQ3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LINC00301Q8NCQ3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LINC00301Q8NCQ3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LINC00301Q8NCQ3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LINC00301Q8NCQ3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LINC00301Q8NCQ3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LINC00301Q8NCQ3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LINC00301Q8NCQ3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LINC00301Q8NCQ3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LINC00301Q8NCQ3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LINC00301Q8NCQ3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LINC00301Q8NCQ3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LINC00301Q8NCQ3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LINC00301Q8NCQ3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LINC00301Q8NCQ3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LINC00301Q8NCQ3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LINC00301Q8NCQ3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LINC00301Q8NCQ3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LINC00301Q8NCQ3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LINC00301Q8NCQ3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LINC00301Q8NCQ3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LINC00301Q8NCQ3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LINC00301Q8NCQ3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LINC00301Q8NCQ3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LINC00301Q8NCQ3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LINC00301Q8NCQ3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LINC00301Q8NCQ3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LINC00301Q8NCQ3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LINC00301Q8NCQ3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LINC00301Q8NCQ3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LINC00301Q8NCQ3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LINC00301Q8NCQ3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LINC00301Q8NCQ3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LINC00301Q8NCQ3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LINC00301Q8NCQ3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LINC00301Q8NCQ3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LINC00301Q8NCQ3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LINC00301Q8NCQ3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LINC00301Q8NCQ3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LINC00301Q8NCQ3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LINC00301Q8NCQ3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LINC00301Q8NCQ3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LINC00301Q8NCQ3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LINC00301Q8NCQ3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LINC00301Q8NCQ3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LINC00301Q8NCQ3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LINC00301Q8NCQ3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LINC00301Q8NCQ3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LINC00301Q8NCQ3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LINC00301Q8NCQ3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LINC00301Q8NCQ3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LINC00301Q8NCQ3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LINC00301Q8NCQ3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LINC00301Q8NCQ3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LINC00301Q8NCQ3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LINC00301Q8NCQ3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LINC00301Q8NCQ3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LINC00301Q8NCQ3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LINC00301Q8NCQ3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LINC00301Q8NCQ3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LINC00301Q8NCQ3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LINC00301Q8NCQ3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LINC00301Q8NCQ3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LINC00301Q8NCQ3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LINC00301Q8NCQ3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LINC00301Q8NCQ3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LINC00301Q8NCQ3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LINC00301Q8NCQ3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LINC00301Q8NCQ3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LINC00301Q8NCQ3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LINC00301Q8NCQ3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LINC00301Q8NCQ3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LINC00301Q8NCQ3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LINC00301Q8NCQ3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LINC00301Q8NCQ3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LINC00301Q8NCQ3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LINC00301Q8NCQ3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LINC00301Q8NCQ3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LINC00301Q8NCQ3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LINC00301Q8NCQ3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LINC00301Q8NCQ3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LINC00301Q8NCQ3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LINC00301Q8NCQ3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LINC00301Q8NCQ3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LINC00301Q8NCQ3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LINC00301Q8NCQ3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LINC00301Q8NCQ3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LINC00301Q8NCQ3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LINC00301Q8NCQ3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LINC00301Q8NCQ3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LINC00301Q8NCQ3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LINC00301Q8NCQ3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms