Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Q1

TMCO5A, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5AQ8N6Q1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TMCO5AQ8N6Q1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TMCO5AQ8N6Q1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TMCO5AQ8N6Q1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TMCO5AQ8N6Q1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TMCO5AQ8N6Q1 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMCO5AQ8N6Q1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMCO5AQ8N6Q1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TMCO5AQ8N6Q1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TMCO5AQ8N6Q1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMCO5AQ8N6Q1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMCO5AQ8N6Q1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMCO5AQ8N6Q1 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMCO5AQ8N6Q1 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMCO5AQ8N6Q1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMCO5AQ8N6Q1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMCO5AQ8N6Q1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMCO5AQ8N6Q1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMCO5AQ8N6Q1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMCO5AQ8N6Q1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMCO5AQ8N6Q1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMCO5AQ8N6Q1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMCO5AQ8N6Q1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TMCO5AQ8N6Q1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMCO5AQ8N6Q1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TMCO5AQ8N6Q1 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMCO5AQ8N6Q1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMCO5AQ8N6Q1 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMCO5AQ8N6Q1 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMCO5AQ8N6Q1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMCO5AQ8N6Q1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMCO5AQ8N6Q1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMCO5AQ8N6Q1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMCO5AQ8N6Q1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMCO5AQ8N6Q1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMCO5AQ8N6Q1 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMCO5AQ8N6Q1 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMCO5AQ8N6Q1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMCO5AQ8N6Q1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMCO5AQ8N6Q1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMCO5AQ8N6Q1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMCO5AQ8N6Q1 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMCO5AQ8N6Q1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMCO5AQ8N6Q1 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMCO5AQ8N6Q1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMCO5AQ8N6Q1 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMCO5AQ8N6Q1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMCO5AQ8N6Q1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMCO5AQ8N6Q1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMCO5AQ8N6Q1 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMCO5AQ8N6Q1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMCO5AQ8N6Q1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TMCO5AQ8N6Q1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMCO5AQ8N6Q1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TMCO5AQ8N6Q1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMCO5AQ8N6Q1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TMCO5AQ8N6Q1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMCO5AQ8N6Q1 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMCO5AQ8N6Q1 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMCO5AQ8N6Q1 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMCO5AQ8N6Q1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMCO5AQ8N6Q1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMCO5AQ8N6Q1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMCO5AQ8N6Q1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMCO5AQ8N6Q1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMCO5AQ8N6Q1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMCO5AQ8N6Q1 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMCO5AQ8N6Q1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMCO5AQ8N6Q1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TMCO5AQ8N6Q1 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMCO5AQ8N6Q1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMCO5AQ8N6Q1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMCO5AQ8N6Q1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMCO5AQ8N6Q1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMCO5AQ8N6Q1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMCO5AQ8N6Q1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TMCO5AQ8N6Q1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMCO5AQ8N6Q1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMCO5AQ8N6Q1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMCO5AQ8N6Q1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMCO5AQ8N6Q1 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMCO5AQ8N6Q1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMCO5AQ8N6Q1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMCO5AQ8N6Q1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMCO5AQ8N6Q1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMCO5AQ8N6Q1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMCO5AQ8N6Q1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
TMCO5AQ8N6Q1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMCO5AQ8N6Q1 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMCO5AQ8N6Q1 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMCO5AQ8N6Q1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMCO5AQ8N6Q1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMCO5AQ8N6Q1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMCO5AQ8N6Q1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMCO5AQ8N6Q1 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMCO5AQ8N6Q1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMCO5AQ8N6Q1 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMCO5AQ8N6Q1 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMCO5AQ8N6Q1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMCO5AQ8N6Q1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.7 ms