Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z403

TMC6, Transmembrane channel-like protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC6Q7Z403 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMC6Q7Z403 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMC6Q7Z403 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMC6Q7Z403 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMC6Q7Z403 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMC6Q7Z403 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMC6Q7Z403 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMC6Q7Z403 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMC6Q7Z403 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMC6Q7Z403 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMC6Q7Z403 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMC6Q7Z403 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMC6Q7Z403 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
TMC6Q7Z403 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMC6Q7Z403 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMC6Q7Z403 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMC6Q7Z403 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMC6Q7Z403 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMC6Q7Z403 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMC6Q7Z403 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMC6Q7Z403 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMC6Q7Z403 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMC6Q7Z403 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMC6Q7Z403 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMC6Q7Z403 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TMC6Q7Z403 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMC6Q7Z403 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMC6Q7Z403 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMC6Q7Z403 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMC6Q7Z403 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMC6Q7Z403 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMC6Q7Z403 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMC6Q7Z403 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMC6Q7Z403 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMC6Q7Z403 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMC6Q7Z403 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMC6Q7Z403 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMC6Q7Z403 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMC6Q7Z403 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMC6Q7Z403 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMC6Q7Z403 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMC6Q7Z403 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMC6Q7Z403 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMC6Q7Z403 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMC6Q7Z403 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TMC6Q7Z403 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMC6Q7Z403 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMC6Q7Z403 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TMC6Q7Z403 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMC6Q7Z403 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMC6Q7Z403 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMC6Q7Z403 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMC6Q7Z403 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMC6Q7Z403 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMC6Q7Z403 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMC6Q7Z403 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMC6Q7Z403 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMC6Q7Z403 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMC6Q7Z403 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMC6Q7Z403 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMC6Q7Z403 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMC6Q7Z403 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMC6Q7Z403 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMC6Q7Z403 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMC6Q7Z403 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMC6Q7Z403 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMC6Q7Z403 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMC6Q7Z403 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMC6Q7Z403 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMC6Q7Z403 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMC6Q7Z403 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMC6Q7Z403 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMC6Q7Z403 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMC6Q7Z403 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMC6Q7Z403 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMC6Q7Z403 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMC6Q7Z403 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMC6Q7Z403 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMC6Q7Z403 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMC6Q7Z403 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMC6Q7Z403 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMC6Q7Z403 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMC6Q7Z403 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMC6Q7Z403 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMC6Q7Z403 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMC6Q7Z403 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMC6Q7Z403 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMC6Q7Z403 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMC6Q7Z403 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMC6Q7Z403 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMC6Q7Z403 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMC6Q7Z403 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMC6Q7Z403 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMC6Q7Z403 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMC6Q7Z403 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMC6Q7Z403 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMC6Q7Z403 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMC6Q7Z403 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMC6Q7Z403 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMC6Q7Z403 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms