Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM43BQ6ZT52 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM43BQ6ZT52 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM43BQ6ZT52 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM43BQ6ZT52 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM43BQ6ZT52 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM43BQ6ZT52 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM43BQ6ZT52 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM43BQ6ZT52 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM43BQ6ZT52 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM43BQ6ZT52 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM43BQ6ZT52 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM43BQ6ZT52 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM43BQ6ZT52 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM43BQ6ZT52 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM43BQ6ZT52 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM43BQ6ZT52 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM43BQ6ZT52 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM43BQ6ZT52 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM43BQ6ZT52 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM43BQ6ZT52 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM43BQ6ZT52 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM43BQ6ZT52 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM43BQ6ZT52 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM43BQ6ZT52 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM43BQ6ZT52 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM43BQ6ZT52 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM43BQ6ZT52 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM43BQ6ZT52 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM43BQ6ZT52 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM43BQ6ZT52 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM43BQ6ZT52 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM43BQ6ZT52 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM43BQ6ZT52 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM43BQ6ZT52 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM43BQ6ZT52 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM43BQ6ZT52 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM43BQ6ZT52 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM43BQ6ZT52 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM43BQ6ZT52 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM43BQ6ZT52 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM43BQ6ZT52 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM43BQ6ZT52 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM43BQ6ZT52 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM43BQ6ZT52 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM43BQ6ZT52 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM43BQ6ZT52 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM43BQ6ZT52 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM43BQ6ZT52 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM43BQ6ZT52 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM43BQ6ZT52 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM43BQ6ZT52 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM43BQ6ZT52 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM43BQ6ZT52 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM43BQ6ZT52 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM43BQ6ZT52 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM43BQ6ZT52 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM43BQ6ZT52 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM43BQ6ZT52 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM43BQ6ZT52 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM43BQ6ZT52 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM43BQ6ZT52 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM43BQ6ZT52 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM43BQ6ZT52 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM43BQ6ZT52 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM43BQ6ZT52 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM43BQ6ZT52 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM43BQ6ZT52 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM43BQ6ZT52 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM43BQ6ZT52 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM43BQ6ZT52 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM43BQ6ZT52 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM43BQ6ZT52 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM43BQ6ZT52 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM43BQ6ZT52 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM43BQ6ZT52 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM43BQ6ZT52 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM43BQ6ZT52 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM43BQ6ZT52 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM43BQ6ZT52 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM43BQ6ZT52 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM43BQ6ZT52 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM43BQ6ZT52 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FAM43BQ6ZT52 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FAM43BQ6ZT52 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FAM43BQ6ZT52 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FAM43BQ6ZT52 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FAM43BQ6ZT52 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FAM43BQ6ZT52 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FAM43BQ6ZT52 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
FAM43BQ6ZT52 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
FAM43BQ6ZT52 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23■■□□□ 1.27
FAM43BQ6ZT52 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
FAM43BQ6ZT52 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FAM43BQ6ZT52 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FAM43BQ6ZT52 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM43BQ6ZT52 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM43BQ6ZT52 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM43BQ6ZT52 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM43BQ6ZT52 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms