Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC9A4Q6AI14 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC9A4Q6AI14 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC9A4Q6AI14 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC9A4Q6AI14 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC9A4Q6AI14 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC9A4Q6AI14 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC9A4Q6AI14 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC9A4Q6AI14 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC9A4Q6AI14 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC9A4Q6AI14 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC9A4Q6AI14 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC9A4Q6AI14 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC9A4Q6AI14 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC9A4Q6AI14 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC9A4Q6AI14 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC9A4Q6AI14 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC9A4Q6AI14 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC9A4Q6AI14 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC9A4Q6AI14 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC9A4Q6AI14 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC9A4Q6AI14 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC9A4Q6AI14 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC9A4Q6AI14 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC9A4Q6AI14 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC9A4Q6AI14 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC9A4Q6AI14 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC9A4Q6AI14 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC9A4Q6AI14 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC9A4Q6AI14 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC9A4Q6AI14 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC9A4Q6AI14 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC9A4Q6AI14 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC9A4Q6AI14 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC9A4Q6AI14 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC9A4Q6AI14 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC9A4Q6AI14 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC9A4Q6AI14 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC9A4Q6AI14 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC9A4Q6AI14 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC9A4Q6AI14 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC9A4Q6AI14 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC9A4Q6AI14 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC9A4Q6AI14 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC9A4Q6AI14 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC9A4Q6AI14 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC9A4Q6AI14 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC9A4Q6AI14 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC9A4Q6AI14 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC9A4Q6AI14 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC9A4Q6AI14 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC9A4Q6AI14 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC9A4Q6AI14 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC9A4Q6AI14 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC9A4Q6AI14 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC9A4Q6AI14 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC9A4Q6AI14 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC9A4Q6AI14 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC9A4Q6AI14 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC9A4Q6AI14 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC9A4Q6AI14 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC9A4Q6AI14 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC9A4Q6AI14 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC9A4Q6AI14 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC9A4Q6AI14 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC9A4Q6AI14 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC9A4Q6AI14 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC9A4Q6AI14 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC9A4Q6AI14 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC9A4Q6AI14 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC9A4Q6AI14 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC9A4Q6AI14 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC9A4Q6AI14 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC9A4Q6AI14 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC9A4Q6AI14 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC9A4Q6AI14 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC9A4Q6AI14 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC9A4Q6AI14 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC9A4Q6AI14 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC9A4Q6AI14 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC9A4Q6AI14 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC9A4Q6AI14 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC9A4Q6AI14 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC9A4Q6AI14 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC9A4Q6AI14 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC9A4Q6AI14 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC9A4Q6AI14 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC9A4Q6AI14 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC9A4Q6AI14 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC9A4Q6AI14 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC9A4Q6AI14 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC9A4Q6AI14 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC9A4Q6AI14 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC9A4Q6AI14 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC9A4Q6AI14 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC9A4Q6AI14 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC9A4Q6AI14 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC9A4Q6AI14 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC9A4Q6AI14 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC9A4Q6AI14 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms