Protein–RNA interactions for Protein: Q69YN4

VIRMA, Protein virilizer homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIRMAQ69YN4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VIRMAQ69YN4 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VIRMAQ69YN4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
VIRMAQ69YN4 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VIRMAQ69YN4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VIRMAQ69YN4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VIRMAQ69YN4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
VIRMAQ69YN4 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VIRMAQ69YN4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VIRMAQ69YN4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VIRMAQ69YN4 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
VIRMAQ69YN4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
VIRMAQ69YN4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
VIRMAQ69YN4 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
VIRMAQ69YN4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
VIRMAQ69YN4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
VIRMAQ69YN4 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
VIRMAQ69YN4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
VIRMAQ69YN4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
VIRMAQ69YN4 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
VIRMAQ69YN4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
VIRMAQ69YN4 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
VIRMAQ69YN4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
VIRMAQ69YN4 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
VIRMAQ69YN4 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
VIRMAQ69YN4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
VIRMAQ69YN4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
VIRMAQ69YN4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
VIRMAQ69YN4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
VIRMAQ69YN4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
VIRMAQ69YN4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
VIRMAQ69YN4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
VIRMAQ69YN4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
VIRMAQ69YN4 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
VIRMAQ69YN4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
VIRMAQ69YN4 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
VIRMAQ69YN4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
VIRMAQ69YN4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
VIRMAQ69YN4 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
VIRMAQ69YN4 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
VIRMAQ69YN4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
VIRMAQ69YN4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
VIRMAQ69YN4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
VIRMAQ69YN4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
VIRMAQ69YN4 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
VIRMAQ69YN4 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
VIRMAQ69YN4 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
VIRMAQ69YN4 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
VIRMAQ69YN4 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
VIRMAQ69YN4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
VIRMAQ69YN4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
VIRMAQ69YN4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
VIRMAQ69YN4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
VIRMAQ69YN4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
VIRMAQ69YN4 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
VIRMAQ69YN4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
VIRMAQ69YN4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
VIRMAQ69YN4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
VIRMAQ69YN4 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
VIRMAQ69YN4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
VIRMAQ69YN4 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
VIRMAQ69YN4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
VIRMAQ69YN4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
VIRMAQ69YN4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
VIRMAQ69YN4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
VIRMAQ69YN4 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
VIRMAQ69YN4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
VIRMAQ69YN4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
VIRMAQ69YN4 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
VIRMAQ69YN4 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
VIRMAQ69YN4 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
VIRMAQ69YN4 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
VIRMAQ69YN4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
VIRMAQ69YN4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
VIRMAQ69YN4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
VIRMAQ69YN4 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
VIRMAQ69YN4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
VIRMAQ69YN4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
VIRMAQ69YN4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
VIRMAQ69YN4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
VIRMAQ69YN4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
VIRMAQ69YN4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
VIRMAQ69YN4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
VIRMAQ69YN4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
VIRMAQ69YN4 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
VIRMAQ69YN4 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
VIRMAQ69YN4 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
VIRMAQ69YN4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
VIRMAQ69YN4 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
VIRMAQ69YN4 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
VIRMAQ69YN4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
VIRMAQ69YN4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
VIRMAQ69YN4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
VIRMAQ69YN4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
VIRMAQ69YN4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
VIRMAQ69YN4 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
VIRMAQ69YN4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
VIRMAQ69YN4 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
VIRMAQ69YN4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
VIRMAQ69YN4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms