Protein–RNA interactions for Protein: Q68G74

LHX8, LIM/homeobox protein Lhx8, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX8Q68G74 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LHX8Q68G74 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LHX8Q68G74 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LHX8Q68G74 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
LHX8Q68G74 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LHX8Q68G74 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LHX8Q68G74 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LHX8Q68G74 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LHX8Q68G74 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LHX8Q68G74 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
LHX8Q68G74 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LHX8Q68G74 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LHX8Q68G74 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LHX8Q68G74 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LHX8Q68G74 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LHX8Q68G74 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LHX8Q68G74 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LHX8Q68G74 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LHX8Q68G74 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LHX8Q68G74 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
LHX8Q68G74 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LHX8Q68G74 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LHX8Q68G74 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LHX8Q68G74 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LHX8Q68G74 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LHX8Q68G74 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LHX8Q68G74 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LHX8Q68G74 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LHX8Q68G74 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LHX8Q68G74 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LHX8Q68G74 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LHX8Q68G74 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LHX8Q68G74 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LHX8Q68G74 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LHX8Q68G74 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LHX8Q68G74 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LHX8Q68G74 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LHX8Q68G74 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LHX8Q68G74 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LHX8Q68G74 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
LHX8Q68G74 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
LHX8Q68G74 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LHX8Q68G74 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LHX8Q68G74 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LHX8Q68G74 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LHX8Q68G74 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LHX8Q68G74 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LHX8Q68G74 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LHX8Q68G74 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LHX8Q68G74 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LHX8Q68G74 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LHX8Q68G74 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LHX8Q68G74 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LHX8Q68G74 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LHX8Q68G74 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LHX8Q68G74 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LHX8Q68G74 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LHX8Q68G74 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LHX8Q68G74 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
LHX8Q68G74 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LHX8Q68G74 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LHX8Q68G74 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LHX8Q68G74 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LHX8Q68G74 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LHX8Q68G74 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LHX8Q68G74 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LHX8Q68G74 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LHX8Q68G74 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LHX8Q68G74 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LHX8Q68G74 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LHX8Q68G74 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LHX8Q68G74 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LHX8Q68G74 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LHX8Q68G74 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LHX8Q68G74 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LHX8Q68G74 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LHX8Q68G74 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LHX8Q68G74 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LHX8Q68G74 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LHX8Q68G74 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LHX8Q68G74 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LHX8Q68G74 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LHX8Q68G74 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
LHX8Q68G74 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LHX8Q68G74 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LHX8Q68G74 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LHX8Q68G74 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
LHX8Q68G74 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LHX8Q68G74 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LHX8Q68G74 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LHX8Q68G74 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LHX8Q68G74 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LHX8Q68G74 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LHX8Q68G74 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
LHX8Q68G74 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LHX8Q68G74 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LHX8Q68G74 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LHX8Q68G74 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LHX8Q68G74 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LHX8Q68G74 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms