Protein–RNA interactions for Protein: Q68DH5

LMBRD2, LMBR1 domain-containing protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD2Q68DH5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMBRD2Q68DH5 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMBRD2Q68DH5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMBRD2Q68DH5 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMBRD2Q68DH5 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMBRD2Q68DH5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMBRD2Q68DH5 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMBRD2Q68DH5 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LMBRD2Q68DH5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMBRD2Q68DH5 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMBRD2Q68DH5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMBRD2Q68DH5 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMBRD2Q68DH5 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMBRD2Q68DH5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMBRD2Q68DH5 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMBRD2Q68DH5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMBRD2Q68DH5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMBRD2Q68DH5 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMBRD2Q68DH5 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMBRD2Q68DH5 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMBRD2Q68DH5 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LMBRD2Q68DH5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMBRD2Q68DH5 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMBRD2Q68DH5 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMBRD2Q68DH5 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LMBRD2Q68DH5 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMBRD2Q68DH5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMBRD2Q68DH5 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMBRD2Q68DH5 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMBRD2Q68DH5 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMBRD2Q68DH5 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMBRD2Q68DH5 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMBRD2Q68DH5 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMBRD2Q68DH5 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMBRD2Q68DH5 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LMBRD2Q68DH5 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LMBRD2Q68DH5 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LMBRD2Q68DH5 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LMBRD2Q68DH5 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LMBRD2Q68DH5 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LMBRD2Q68DH5 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LMBRD2Q68DH5 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LMBRD2Q68DH5 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
LMBRD2Q68DH5 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LMBRD2Q68DH5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LMBRD2Q68DH5 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LMBRD2Q68DH5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LMBRD2Q68DH5 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LMBRD2Q68DH5 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LMBRD2Q68DH5 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMBRD2Q68DH5 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LMBRD2Q68DH5 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMBRD2Q68DH5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMBRD2Q68DH5 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMBRD2Q68DH5 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMBRD2Q68DH5 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMBRD2Q68DH5 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMBRD2Q68DH5 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMBRD2Q68DH5 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMBRD2Q68DH5 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMBRD2Q68DH5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMBRD2Q68DH5 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMBRD2Q68DH5 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMBRD2Q68DH5 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMBRD2Q68DH5 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMBRD2Q68DH5 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMBRD2Q68DH5 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMBRD2Q68DH5 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMBRD2Q68DH5 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMBRD2Q68DH5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMBRD2Q68DH5 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMBRD2Q68DH5 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMBRD2Q68DH5 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMBRD2Q68DH5 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMBRD2Q68DH5 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMBRD2Q68DH5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMBRD2Q68DH5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMBRD2Q68DH5 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMBRD2Q68DH5 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMBRD2Q68DH5 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMBRD2Q68DH5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMBRD2Q68DH5 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMBRD2Q68DH5 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMBRD2Q68DH5 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMBRD2Q68DH5 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMBRD2Q68DH5 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMBRD2Q68DH5 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMBRD2Q68DH5 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMBRD2Q68DH5 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMBRD2Q68DH5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMBRD2Q68DH5 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMBRD2Q68DH5 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMBRD2Q68DH5 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMBRD2Q68DH5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMBRD2Q68DH5 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMBRD2Q68DH5 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMBRD2Q68DH5 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMBRD2Q68DH5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMBRD2Q68DH5 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMBRD2Q68DH5 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms