Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
ATG16L1Q676U5 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATG16L1Q676U5 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATG16L1Q676U5 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATG16L1Q676U5 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATG16L1Q676U5 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATG16L1Q676U5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATG16L1Q676U5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATG16L1Q676U5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATG16L1Q676U5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ATG16L1Q676U5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ATG16L1Q676U5 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATG16L1Q676U5 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATG16L1Q676U5 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATG16L1Q676U5 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATG16L1Q676U5 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATG16L1Q676U5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ATG16L1Q676U5 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATG16L1Q676U5 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATG16L1Q676U5 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATG16L1Q676U5 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATG16L1Q676U5 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATG16L1Q676U5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATG16L1Q676U5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATG16L1Q676U5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATG16L1Q676U5 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATG16L1Q676U5 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATG16L1Q676U5 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATG16L1Q676U5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATG16L1Q676U5 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATG16L1Q676U5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATG16L1Q676U5 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG16L1Q676U5 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG16L1Q676U5 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG16L1Q676U5 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG16L1Q676U5 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG16L1Q676U5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG16L1Q676U5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG16L1Q676U5 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG16L1Q676U5 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG16L1Q676U5 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG16L1Q676U5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG16L1Q676U5 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG16L1Q676U5 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG16L1Q676U5 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG16L1Q676U5 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG16L1Q676U5 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG16L1Q676U5 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG16L1Q676U5 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG16L1Q676U5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG16L1Q676U5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG16L1Q676U5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG16L1Q676U5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG16L1Q676U5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG16L1Q676U5 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG16L1Q676U5 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG16L1Q676U5 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG16L1Q676U5 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG16L1Q676U5 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG16L1Q676U5 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG16L1Q676U5 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG16L1Q676U5 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG16L1Q676U5 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG16L1Q676U5 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG16L1Q676U5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG16L1Q676U5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG16L1Q676U5 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG16L1Q676U5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG16L1Q676U5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG16L1Q676U5 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG16L1Q676U5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms