Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTH9

WDR78, WD repeat-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR78Q5VTH9 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
WDR78Q5VTH9 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
WDR78Q5VTH9 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
WDR78Q5VTH9 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
WDR78Q5VTH9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
WDR78Q5VTH9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
WDR78Q5VTH9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
WDR78Q5VTH9 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
WDR78Q5VTH9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
WDR78Q5VTH9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
WDR78Q5VTH9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
WDR78Q5VTH9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
WDR78Q5VTH9 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
WDR78Q5VTH9 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
WDR78Q5VTH9 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
WDR78Q5VTH9 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
WDR78Q5VTH9 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
WDR78Q5VTH9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
WDR78Q5VTH9 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
WDR78Q5VTH9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
WDR78Q5VTH9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
WDR78Q5VTH9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
WDR78Q5VTH9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
WDR78Q5VTH9 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
WDR78Q5VTH9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
WDR78Q5VTH9 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
WDR78Q5VTH9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
WDR78Q5VTH9 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
WDR78Q5VTH9 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
WDR78Q5VTH9 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
WDR78Q5VTH9 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
WDR78Q5VTH9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
WDR78Q5VTH9 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
WDR78Q5VTH9 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
WDR78Q5VTH9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
WDR78Q5VTH9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
WDR78Q5VTH9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
WDR78Q5VTH9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
WDR78Q5VTH9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
WDR78Q5VTH9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
WDR78Q5VTH9 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
WDR78Q5VTH9 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
WDR78Q5VTH9 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
WDR78Q5VTH9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
WDR78Q5VTH9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
WDR78Q5VTH9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
WDR78Q5VTH9 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
WDR78Q5VTH9 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
WDR78Q5VTH9 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
WDR78Q5VTH9 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
WDR78Q5VTH9 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
WDR78Q5VTH9 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
WDR78Q5VTH9 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
WDR78Q5VTH9 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
WDR78Q5VTH9 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
WDR78Q5VTH9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
WDR78Q5VTH9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
WDR78Q5VTH9 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
WDR78Q5VTH9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
WDR78Q5VTH9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
WDR78Q5VTH9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
WDR78Q5VTH9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
WDR78Q5VTH9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
WDR78Q5VTH9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
WDR78Q5VTH9 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
WDR78Q5VTH9 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
WDR78Q5VTH9 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
WDR78Q5VTH9 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
WDR78Q5VTH9 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
WDR78Q5VTH9 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
WDR78Q5VTH9 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
WDR78Q5VTH9 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
WDR78Q5VTH9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
WDR78Q5VTH9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
WDR78Q5VTH9 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
WDR78Q5VTH9 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
WDR78Q5VTH9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
WDR78Q5VTH9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
WDR78Q5VTH9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
WDR78Q5VTH9 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
WDR78Q5VTH9 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
WDR78Q5VTH9 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
WDR78Q5VTH9 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
WDR78Q5VTH9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
WDR78Q5VTH9 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
WDR78Q5VTH9 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
WDR78Q5VTH9 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
WDR78Q5VTH9 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
WDR78Q5VTH9 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
WDR78Q5VTH9 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
WDR78Q5VTH9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
WDR78Q5VTH9 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
WDR78Q5VTH9 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
WDR78Q5VTH9 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
WDR78Q5VTH9 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
WDR78Q5VTH9 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
WDR78Q5VTH9 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
WDR78Q5VTH9 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
WDR78Q5VTH9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
WDR78Q5VTH9 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms