Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HES3Q5TGS1 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
HES3Q5TGS1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HES3Q5TGS1 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HES3Q5TGS1 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HES3Q5TGS1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HES3Q5TGS1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HES3Q5TGS1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HES3Q5TGS1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HES3Q5TGS1 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HES3Q5TGS1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HES3Q5TGS1 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HES3Q5TGS1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HES3Q5TGS1 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HES3Q5TGS1 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HES3Q5TGS1 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HES3Q5TGS1 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HES3Q5TGS1 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HES3Q5TGS1 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
HES3Q5TGS1 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HES3Q5TGS1 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HES3Q5TGS1 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HES3Q5TGS1 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HES3Q5TGS1 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HES3Q5TGS1 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HES3Q5TGS1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
HES3Q5TGS1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
HES3Q5TGS1 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
HES3Q5TGS1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HES3Q5TGS1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HES3Q5TGS1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HES3Q5TGS1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HES3Q5TGS1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HES3Q5TGS1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HES3Q5TGS1 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HES3Q5TGS1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HES3Q5TGS1 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HES3Q5TGS1 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HES3Q5TGS1 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HES3Q5TGS1 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HES3Q5TGS1 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HES3Q5TGS1 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HES3Q5TGS1 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HES3Q5TGS1 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HES3Q5TGS1 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HES3Q5TGS1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HES3Q5TGS1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HES3Q5TGS1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HES3Q5TGS1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HES3Q5TGS1 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HES3Q5TGS1 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
HES3Q5TGS1 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HES3Q5TGS1 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HES3Q5TGS1 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HES3Q5TGS1 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HES3Q5TGS1 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HES3Q5TGS1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HES3Q5TGS1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HES3Q5TGS1 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HES3Q5TGS1 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HES3Q5TGS1 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HES3Q5TGS1 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HES3Q5TGS1 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HES3Q5TGS1 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HES3Q5TGS1 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HES3Q5TGS1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HES3Q5TGS1 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HES3Q5TGS1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HES3Q5TGS1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HES3Q5TGS1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HES3Q5TGS1 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HES3Q5TGS1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HES3Q5TGS1 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HES3Q5TGS1 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HES3Q5TGS1 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HES3Q5TGS1 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HES3Q5TGS1 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HES3Q5TGS1 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HES3Q5TGS1 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HES3Q5TGS1 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HES3Q5TGS1 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HES3Q5TGS1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
HES3Q5TGS1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HES3Q5TGS1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HES3Q5TGS1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HES3Q5TGS1 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HES3Q5TGS1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HES3Q5TGS1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HES3Q5TGS1 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HES3Q5TGS1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HES3Q5TGS1 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HES3Q5TGS1 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HES3Q5TGS1 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HES3Q5TGS1 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HES3Q5TGS1 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HES3Q5TGS1 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
HES3Q5TGS1 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HES3Q5TGS1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HES3Q5TGS1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HES3Q5TGS1 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms