Protein–RNA interactions for Protein: Q53SF7

COBLL1, Cordon-bleu protein-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COBLL1Q53SF7 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COBLL1Q53SF7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COBLL1Q53SF7 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COBLL1Q53SF7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COBLL1Q53SF7 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COBLL1Q53SF7 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COBLL1Q53SF7 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COBLL1Q53SF7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COBLL1Q53SF7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COBLL1Q53SF7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COBLL1Q53SF7 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COBLL1Q53SF7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COBLL1Q53SF7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COBLL1Q53SF7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COBLL1Q53SF7 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COBLL1Q53SF7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COBLL1Q53SF7 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COBLL1Q53SF7 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
COBLL1Q53SF7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COBLL1Q53SF7 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COBLL1Q53SF7 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COBLL1Q53SF7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COBLL1Q53SF7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
COBLL1Q53SF7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COBLL1Q53SF7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COBLL1Q53SF7 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COBLL1Q53SF7 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COBLL1Q53SF7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COBLL1Q53SF7 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COBLL1Q53SF7 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COBLL1Q53SF7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COBLL1Q53SF7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COBLL1Q53SF7 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COBLL1Q53SF7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COBLL1Q53SF7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
COBLL1Q53SF7 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COBLL1Q53SF7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COBLL1Q53SF7 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COBLL1Q53SF7 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COBLL1Q53SF7 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COBLL1Q53SF7 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COBLL1Q53SF7 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COBLL1Q53SF7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COBLL1Q53SF7 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COBLL1Q53SF7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COBLL1Q53SF7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COBLL1Q53SF7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COBLL1Q53SF7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COBLL1Q53SF7 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
COBLL1Q53SF7 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
COBLL1Q53SF7 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COBLL1Q53SF7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COBLL1Q53SF7 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COBLL1Q53SF7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COBLL1Q53SF7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COBLL1Q53SF7 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COBLL1Q53SF7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COBLL1Q53SF7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COBLL1Q53SF7 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COBLL1Q53SF7 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COBLL1Q53SF7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COBLL1Q53SF7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COBLL1Q53SF7 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COBLL1Q53SF7 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COBLL1Q53SF7 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COBLL1Q53SF7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COBLL1Q53SF7 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COBLL1Q53SF7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COBLL1Q53SF7 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COBLL1Q53SF7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COBLL1Q53SF7 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COBLL1Q53SF7 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COBLL1Q53SF7 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COBLL1Q53SF7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COBLL1Q53SF7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COBLL1Q53SF7 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COBLL1Q53SF7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COBLL1Q53SF7 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COBLL1Q53SF7 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COBLL1Q53SF7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COBLL1Q53SF7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COBLL1Q53SF7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COBLL1Q53SF7 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
COBLL1Q53SF7 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COBLL1Q53SF7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COBLL1Q53SF7 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COBLL1Q53SF7 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COBLL1Q53SF7 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COBLL1Q53SF7 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COBLL1Q53SF7 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COBLL1Q53SF7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COBLL1Q53SF7 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COBLL1Q53SF7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COBLL1Q53SF7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COBLL1Q53SF7 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COBLL1Q53SF7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COBLL1Q53SF7 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COBLL1Q53SF7 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COBLL1Q53SF7 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COBLL1Q53SF7 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms