Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

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Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TPRNQ4KMQ1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TPRNQ4KMQ1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TPRNQ4KMQ1 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TPRNQ4KMQ1 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TPRNQ4KMQ1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TPRNQ4KMQ1 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TPRNQ4KMQ1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TPRNQ4KMQ1 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TPRNQ4KMQ1 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TPRNQ4KMQ1 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TPRNQ4KMQ1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TPRNQ4KMQ1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TPRNQ4KMQ1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TPRNQ4KMQ1 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TPRNQ4KMQ1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TPRNQ4KMQ1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TPRNQ4KMQ1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TPRNQ4KMQ1 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TPRNQ4KMQ1 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TPRNQ4KMQ1 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TPRNQ4KMQ1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TPRNQ4KMQ1 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TPRNQ4KMQ1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TPRNQ4KMQ1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TPRNQ4KMQ1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TPRNQ4KMQ1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TPRNQ4KMQ1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TPRNQ4KMQ1 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TPRNQ4KMQ1 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TPRNQ4KMQ1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TPRNQ4KMQ1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TPRNQ4KMQ1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TPRNQ4KMQ1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TPRNQ4KMQ1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TPRNQ4KMQ1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TPRNQ4KMQ1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TPRNQ4KMQ1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TPRNQ4KMQ1 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TPRNQ4KMQ1 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TPRNQ4KMQ1 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TPRNQ4KMQ1 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TPRNQ4KMQ1 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TPRNQ4KMQ1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TPRNQ4KMQ1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TPRNQ4KMQ1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TPRNQ4KMQ1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TPRNQ4KMQ1 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TPRNQ4KMQ1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TPRNQ4KMQ1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TPRNQ4KMQ1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TPRNQ4KMQ1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TPRNQ4KMQ1 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TPRNQ4KMQ1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TPRNQ4KMQ1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TPRNQ4KMQ1 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TPRNQ4KMQ1 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TPRNQ4KMQ1 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TPRNQ4KMQ1 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TPRNQ4KMQ1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TPRNQ4KMQ1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TPRNQ4KMQ1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TPRNQ4KMQ1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TPRNQ4KMQ1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TPRNQ4KMQ1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TPRNQ4KMQ1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TPRNQ4KMQ1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TPRNQ4KMQ1 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TPRNQ4KMQ1 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TPRNQ4KMQ1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TPRNQ4KMQ1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TPRNQ4KMQ1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TPRNQ4KMQ1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TPRNQ4KMQ1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TPRNQ4KMQ1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TPRNQ4KMQ1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TPRNQ4KMQ1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TPRNQ4KMQ1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TPRNQ4KMQ1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TPRNQ4KMQ1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TPRNQ4KMQ1 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TPRNQ4KMQ1 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TPRNQ4KMQ1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TPRNQ4KMQ1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TPRNQ4KMQ1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TPRNQ4KMQ1 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TPRNQ4KMQ1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TPRNQ4KMQ1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TPRNQ4KMQ1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TPRNQ4KMQ1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TPRNQ4KMQ1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TPRNQ4KMQ1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TPRNQ4KMQ1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TPRNQ4KMQ1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TPRNQ4KMQ1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TPRNQ4KMQ1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TPRNQ4KMQ1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TPRNQ4KMQ1 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TPRNQ4KMQ1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TPRNQ4KMQ1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
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