Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RNF212Q495C1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms