Protein–RNA interactions for Protein: Q16649

NFIL3, Nuclear factor interleukin-3-regulated protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIL3Q16649 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFIL3Q16649 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFIL3Q16649 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFIL3Q16649 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFIL3Q16649 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFIL3Q16649 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFIL3Q16649 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFIL3Q16649 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFIL3Q16649 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFIL3Q16649 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFIL3Q16649 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFIL3Q16649 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFIL3Q16649 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFIL3Q16649 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFIL3Q16649 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NFIL3Q16649 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFIL3Q16649 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFIL3Q16649 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFIL3Q16649 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NFIL3Q16649 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFIL3Q16649 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFIL3Q16649 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NFIL3Q16649 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFIL3Q16649 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFIL3Q16649 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFIL3Q16649 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFIL3Q16649 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFIL3Q16649 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFIL3Q16649 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFIL3Q16649 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFIL3Q16649 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFIL3Q16649 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFIL3Q16649 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFIL3Q16649 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFIL3Q16649 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFIL3Q16649 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFIL3Q16649 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFIL3Q16649 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFIL3Q16649 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFIL3Q16649 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFIL3Q16649 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFIL3Q16649 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFIL3Q16649 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFIL3Q16649 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFIL3Q16649 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFIL3Q16649 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFIL3Q16649 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFIL3Q16649 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFIL3Q16649 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFIL3Q16649 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFIL3Q16649 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFIL3Q16649 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFIL3Q16649 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFIL3Q16649 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFIL3Q16649 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFIL3Q16649 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFIL3Q16649 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFIL3Q16649 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFIL3Q16649 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFIL3Q16649 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFIL3Q16649 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NFIL3Q16649 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFIL3Q16649 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFIL3Q16649 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFIL3Q16649 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFIL3Q16649 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NFIL3Q16649 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFIL3Q16649 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFIL3Q16649 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFIL3Q16649 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFIL3Q16649 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFIL3Q16649 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFIL3Q16649 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFIL3Q16649 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFIL3Q16649 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFIL3Q16649 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFIL3Q16649 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFIL3Q16649 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFIL3Q16649 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NFIL3Q16649 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NFIL3Q16649 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFIL3Q16649 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFIL3Q16649 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFIL3Q16649 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFIL3Q16649 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFIL3Q16649 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFIL3Q16649 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFIL3Q16649 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NFIL3Q16649 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFIL3Q16649 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFIL3Q16649 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFIL3Q16649 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFIL3Q16649 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFIL3Q16649 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFIL3Q16649 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFIL3Q16649 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFIL3Q16649 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFIL3Q16649 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFIL3Q16649 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFIL3Q16649 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
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