Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CNN3Q15417 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CNN3Q15417 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CNN3Q15417 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CNN3Q15417 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CNN3Q15417 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CNN3Q15417 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CNN3Q15417 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CNN3Q15417 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
CNN3Q15417 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CNN3Q15417 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNN3Q15417 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNN3Q15417 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNN3Q15417 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CNN3Q15417 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNN3Q15417 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNN3Q15417 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNN3Q15417 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNN3Q15417 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNN3Q15417 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNN3Q15417 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNN3Q15417 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNN3Q15417 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNN3Q15417 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CNN3Q15417 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNN3Q15417 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNN3Q15417 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNN3Q15417 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNN3Q15417 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNN3Q15417 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNN3Q15417 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNN3Q15417 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNN3Q15417 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNN3Q15417 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNN3Q15417 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNN3Q15417 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNN3Q15417 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNN3Q15417 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNN3Q15417 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CNN3Q15417 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CNN3Q15417 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNN3Q15417 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CNN3Q15417 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNN3Q15417 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNN3Q15417 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNN3Q15417 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNN3Q15417 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNN3Q15417 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNN3Q15417 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNN3Q15417 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNN3Q15417 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNN3Q15417 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CNN3Q15417 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNN3Q15417 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNN3Q15417 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNN3Q15417 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNN3Q15417 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNN3Q15417 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CNN3Q15417 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNN3Q15417 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNN3Q15417 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNN3Q15417 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNN3Q15417 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNN3Q15417 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNN3Q15417 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNN3Q15417 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNN3Q15417 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNN3Q15417 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNN3Q15417 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNN3Q15417 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNN3Q15417 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNN3Q15417 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNN3Q15417 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNN3Q15417 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNN3Q15417 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNN3Q15417 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CNN3Q15417 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNN3Q15417 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNN3Q15417 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CNN3Q15417 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNN3Q15417 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNN3Q15417 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNN3Q15417 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNN3Q15417 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNN3Q15417 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNN3Q15417 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNN3Q15417 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNN3Q15417 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNN3Q15417 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNN3Q15417 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
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