Protein–RNA interactions for Protein: Q14527

HLTF, Helicase-like transcription factor, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLTFQ14527 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.723e-6■■□□□ 11.8
HLTFQ14527 SMCHD1-206ENST00000581631 729 ntTSL 33.78□□□□□ -1.83e-6■■□□□ 11.8
HLTFQ14527 SMCHD1-203ENST00000577880 4951 ntTSL 23.23□□□□□ -1.893e-6■■□□□ 11.8
HLTFQ14527 SMCHD1-211ENST00000584897 4143 ntTSL 22.53□□□□□ -23e-6■■□□□ 11.8
HLTFQ14527 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.066e-7■■□□□ 11.7
HLTFQ14527 USP9X-201ENST00000324545 12401 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.016e-7■■□□□ 11.7
HLTFQ14527 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.173e-6■■□□□ 11.7
HLTFQ14527 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.723e-6■■□□□ 11.7
HLTFQ14527 LATS1-203ENST00000441107 3879 ntTSL 1 (best)3.37□□□□□ -1.873e-6■■□□□ 11.7
HLTFQ14527 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.154e-6■■□□□ 11.7
HLTFQ14527 CFAP36-202ENST00000349456 2048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.324e-6■■□□□ 11.7
HLTFQ14527 CFAP36-205ENST00000407816 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.414e-6■■□□□ 11.7
HLTFQ14527 CFAP36-206ENST00000481791 519 ntTSL 26.04□□□□□ -1.444e-6■■□□□ 11.7
HLTFQ14527 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.648e-13■■□□□ 11.7
HLTFQ14527 KANK1-210ENST00000619269 5688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.538e-13■■□□□ 11.7
HLTFQ14527 KANK1-206ENST00000382303 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.68e-13■■□□□ 11.7
HLTFQ14527 KANK1-209ENST00000489369 7193 ntTSL 510.71□□□□□ -0.78e-13■■□□□ 11.7
HLTFQ14527 KANK1-205ENST00000382297 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.818e-13■■□□□ 11.7
HLTFQ14527 KANK1-201ENST00000354485 6912 ntTSL 29.34□□□□□ -0.918e-13■■□□□ 11.7
HLTFQ14527 LAMA5-212ENST00000495695 780 ntTSL 220■□□□□ 0.797e-11■■□□□ 11.7
HLTFQ14527 LAMA5-203ENST00000370691 3160 ntTSL 1 (best)14.76□□□□□ -0.057e-11■■□□□ 11.7
HLTFQ14527 MBNL2-205ENST00000449284 581 ntTSL 26.18□□□□□ -1.426e-8■■□□□ 11.7
HLTFQ14527 RRBP1-205ENST00000398782 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 224.31■■□□□ 1.486e-7■■□□□ 11.7
HLTFQ14527 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.466e-7■■□□□ 11.7
HLTFQ14527 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.036e-7■■□□□ 11.7
HLTFQ14527 RRBP1-206ENST00000455029 2485 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.066e-7■■□□□ 11.7
HLTFQ14527 RRBP1-203ENST00000377807 3792 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.286e-7■■□□□ 11.7
HLTFQ14527 HCG18-242ENST00000602319 3342 ntBASIC10.8□□□□□ -0.682e-7■■□□□ 11.7
HLTFQ14527 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.232e-6■■□□□ 11.7
HLTFQ14527 SPRED1-203ENST00000561317 527 ntTSL 46.87□□□□□ -1.312e-6■■□□□ 11.7
HLTFQ14527 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.127e-7■■□□□ 11.7
HLTFQ14527 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.064e-6■■□□□ 11.7
HLTFQ14527 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.014e-6■■□□□ 11.7
HLTFQ14527 TBCK-215ENST00000509532 848 ntTSL 511.89□□□□□ -0.512e-9■■□□□ 11.7
HLTFQ14527 NAA15-207ENST00000496716 677 ntTSL 36.19□□□□□ -1.424e-6■■□□□ 11.7
HLTFQ14527 TBCK-210ENST00000506280 532 ntTSL 55.36□□□□□ -1.552e-9■■□□□ 11.7
HLTFQ14527 TBCK-216ENST00000509862 600 ntTSL 43.69□□□□□ -1.822e-9■■□□□ 11.7
HLTFQ14527 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.241e-6■■□□□ 11.7
HLTFQ14527 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC16.18■□□□□ 0.181e-6■■□□□ 11.7
HLTFQ14527 AHSG-203ENST00000478441 1269 ntTSL 213.12□□□□□ -0.314e-52■■□□□ 11.7
HLTFQ14527 AHSG-201ENST00000273784 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.474e-52■■□□□ 11.7
HLTFQ14527 AHSG-202ENST00000411641 1711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.594e-52■■□□□ 11.7
HLTFQ14527 TBL1X-205ENST00000422314 496 ntTSL 223.58■■□□□ 1.371e-6■■□□□ 11.7
HLTFQ14527 TBL1X-204ENST00000415293 565 ntTSL 56.87□□□□□ -1.311e-6■■□□□ 11.7
HLTFQ14527 CEP57-212ENST00000540830 1936 ntTSL 1 (best)16.5■□□□□ 0.235e-7■■□□□ 11.7
HLTFQ14527 CEP57-211ENST00000539855 1739 ntTSL 515□□□□□ -0.015e-7■■□□□ 11.7
HLTFQ14527 CEP57-201ENST00000325486 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.75e-7■■□□□ 11.7
HLTFQ14527 CEP57-202ENST00000325542 3178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.735e-7■■□□□ 11.7
HLTFQ14527 CEP57-207ENST00000537677 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.225e-7■■□□□ 11.7
HLTFQ14527 CEP57-203ENST00000535224 760 ntTSL 36.34□□□□□ -1.395e-7■■□□□ 11.7
HLTFQ14527 CEP57-206ENST00000537093 404 ntTSL 54.26□□□□□ -1.735e-7■■□□□ 11.7
HLTFQ14527 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.955e-7■■□□□ 11.7
HLTFQ14527 HUWE1-202ENST00000262854 14739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.499e-7■■□□□ 11.7
HLTFQ14527 HUWE1-203ENST00000342160 14796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.119e-7■■□□□ 11.7
HLTFQ14527 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.419e-7■■□□□ 11.7
HLTFQ14527 ATP11A-209ENST00000466946 431 ntTSL 57.62□□□□□ -1.192e-6■■□□□ 11.6
HLTFQ14527 FNBP4-201ENST00000263773 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.211e-6■■□□□ 11.6
HLTFQ14527 GOLGA4-211ENST00000498250 560 ntTSL 25.89□□□□□ -1.471e-7■■□□□ 11.6
HLTFQ14527 TTC3-223ENST00000492275 769 ntTSL 325.44■■□□□ 1.661e-7■■□□□ 11.6
HLTFQ14527 TTC3-212ENST00000463216 842 ntTSL 524.06■■□□□ 1.441e-7■■□□□ 11.6
HLTFQ14527 TTC3-224ENST00000494243 861 ntTSL 523.92■■□□□ 1.421e-7■■□□□ 11.6
HLTFQ14527 SRSF1-205ENST00000582730 3117 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.044e-7■■□□□ 11.6
HLTFQ14527 SRSF1-203ENST00000581497 438 ntTSL 37.79□□□□□ -1.164e-7■■□□□ 11.6
HLTFQ14527 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.794e-7■■□□□ 11.6
HLTFQ14527 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.031e-9■■□□□ 11.6
HLTFQ14527 ACADM-211ENST00000528016 546 ntTSL 418.33■□□□□ 0.521e-9■■□□□ 11.6
HLTFQ14527 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.061e-9■■□□□ 11.6
HLTFQ14527 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.051e-9■■□□□ 11.6
HLTFQ14527 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.033e-6■■□□□ 11.6
HLTFQ14527 ACADM-201ENST00000370834 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.081e-9■■□□□ 11.6
HLTFQ14527 DDX39B-203ENST00000417023 561 ntTSL 512.72□□□□□ -0.371e-9■■□□□ 11.6
HLTFQ14527 BCL6-206ENST00000450123 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.431e-9■■□□□ 11.6
HLTFQ14527 ACADM-208ENST00000526129 1536 ntTSL 212.2□□□□□ -0.461e-9■■□□□ 11.6
HLTFQ14527 LRIF1-201ENST00000369763 3475 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.483e-6■■□□□ 11.6
HLTFQ14527 SCN9A-204ENST00000452182 1618 ntTSL 1 (best)11.54□□□□□ -0.563e-12■■□□□ 11.6
HLTFQ14527 SCN9A-205ENST00000454569 1585 ntTSL 1 (best)11.12□□□□□ -0.633e-12■■□□□ 11.6
HLTFQ14527 ACADM-217ENST00000534334 1149 ntTSL 1 (best)8.88□□□□□ -0.991e-9■■□□□ 11.6
HLTFQ14527 BCL6-201ENST00000232014 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.021e-9■■□□□ 11.6
HLTFQ14527 SMARCC1-202ENST00000425518 3827 ntTSL 28.3□□□□□ -1.081e-9■■□□□ 11.6
HLTFQ14527 SMARCC1-204ENST00000462198 785 ntTSL 25.9□□□□□ -1.461e-9■■□□□ 11.6
HLTFQ14527 ACADM-205ENST00000481374 666 ntTSL 35.76□□□□□ -1.491e-9■■□□□ 11.6
HLTFQ14527 ACADM-212ENST00000529059 1357 ntTSL 25.4□□□□□ -1.551e-9■■□□□ 11.6
HLTFQ14527 ACADM-206ENST00000525808 1422 ntTSL 25.26□□□□□ -1.571e-9■■□□□ 11.6
HLTFQ14527 SMARCC1-206ENST00000485737 631 ntTSL 45.08□□□□□ -1.61e-9■■□□□ 11.6
HLTFQ14527 ACADM-209ENST00000526196 1451 ntTSL 1 (best)4.75□□□□□ -1.651e-9■■□□□ 11.6
HLTFQ14527 ACADM-214ENST00000532207 762 ntTSL 24.65□□□□□ -1.671e-9■■□□□ 11.6
HLTFQ14527 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.691e-9■■□□□ 11.6
HLTFQ14527 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.853e-6■■□□□ 11.6
HLTFQ14527 MBNL2-206ENST00000469707 2574 ntTSL 1 (best)8.73□□□□□ -1.016e-8■■□□□ 11.6
HLTFQ14527 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.296e-8■■□□□ 11.6
HLTFQ14527 MBNL2-202ENST00000345429 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.296e-8■■□□□ 11.6
HLTFQ14527 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.326e-8■■□□□ 11.6
HLTFQ14527 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.436e-8■■□□□ 11.6
HLTFQ14527 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC14.1□□□□□ -0.159e-7■■□□□ 11.6
HLTFQ14527 VPS13A-207ENST00000419472 2781 ntTSL 1 (best)6.4□□□□□ -1.381e-8■■□□□ 11.6
HLTFQ14527 ZNF780B-201ENST00000221355 3538 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.779e-8■■□□□ 11.5
HLTFQ14527 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.599e-8■■□□□ 11.5
HLTFQ14527 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.599e-8■■□□□ 11.5
HLTFQ14527 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.661e-6■■□□□ 11.5
HLTFQ14527 AC007780.1-204ENST00000592030 773 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.766e-7■■□□□ 11.5
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