Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IKZF1Q13422 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IKZF1Q13422 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IKZF1Q13422 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
IKZF1Q13422 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IKZF1Q13422 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IKZF1Q13422 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IKZF1Q13422 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IKZF1Q13422 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IKZF1Q13422 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IKZF1Q13422 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IKZF1Q13422 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IKZF1Q13422 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IKZF1Q13422 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IKZF1Q13422 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IKZF1Q13422 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IKZF1Q13422 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IKZF1Q13422 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IKZF1Q13422 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IKZF1Q13422 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IKZF1Q13422 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IKZF1Q13422 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
IKZF1Q13422 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IKZF1Q13422 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
IKZF1Q13422 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IKZF1Q13422 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IKZF1Q13422 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IKZF1Q13422 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IKZF1Q13422 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IKZF1Q13422 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IKZF1Q13422 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IKZF1Q13422 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IKZF1Q13422 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IKZF1Q13422 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IKZF1Q13422 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IKZF1Q13422 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
IKZF1Q13422 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IKZF1Q13422 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IKZF1Q13422 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IKZF1Q13422 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IKZF1Q13422 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IKZF1Q13422 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IKZF1Q13422 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IKZF1Q13422 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
IKZF1Q13422 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IKZF1Q13422 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IKZF1Q13422 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IKZF1Q13422 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IKZF1Q13422 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IKZF1Q13422 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IKZF1Q13422 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IKZF1Q13422 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IKZF1Q13422 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IKZF1Q13422 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IKZF1Q13422 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IKZF1Q13422 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IKZF1Q13422 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IKZF1Q13422 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IKZF1Q13422 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IKZF1Q13422 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
IKZF1Q13422 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IKZF1Q13422 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IKZF1Q13422 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IKZF1Q13422 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IKZF1Q13422 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IKZF1Q13422 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IKZF1Q13422 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IKZF1Q13422 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IKZF1Q13422 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IKZF1Q13422 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IKZF1Q13422 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IKZF1Q13422 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IKZF1Q13422 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IKZF1Q13422 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IKZF1Q13422 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IKZF1Q13422 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IKZF1Q13422 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IKZF1Q13422 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IKZF1Q13422 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IKZF1Q13422 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
IKZF1Q13422 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IKZF1Q13422 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
IKZF1Q13422 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IKZF1Q13422 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IKZF1Q13422 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IKZF1Q13422 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IKZF1Q13422 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IKZF1Q13422 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IKZF1Q13422 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IKZF1Q13422 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IKZF1Q13422 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IKZF1Q13422 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IKZF1Q13422 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IKZF1Q13422 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IKZF1Q13422 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IKZF1Q13422 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IKZF1Q13422 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IKZF1Q13422 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IKZF1Q13422 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IKZF1Q13422 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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