Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCGB2A2Q13296 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCGB2A2Q13296 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCGB2A2Q13296 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCGB2A2Q13296 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCGB2A2Q13296 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCGB2A2Q13296 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCGB2A2Q13296 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCGB2A2Q13296 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCGB2A2Q13296 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCGB2A2Q13296 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCGB2A2Q13296 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCGB2A2Q13296 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCGB2A2Q13296 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCGB2A2Q13296 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCGB2A2Q13296 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCGB2A2Q13296 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCGB2A2Q13296 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCGB2A2Q13296 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCGB2A2Q13296 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCGB2A2Q13296 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCGB2A2Q13296 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCGB2A2Q13296 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCGB2A2Q13296 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCGB2A2Q13296 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCGB2A2Q13296 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCGB2A2Q13296 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCGB2A2Q13296 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCGB2A2Q13296 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCGB2A2Q13296 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SCGB2A2Q13296 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCGB2A2Q13296 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCGB2A2Q13296 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCGB2A2Q13296 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SCGB2A2Q13296 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCGB2A2Q13296 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCGB2A2Q13296 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCGB2A2Q13296 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SCGB2A2Q13296 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SCGB2A2Q13296 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SCGB2A2Q13296 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SCGB2A2Q13296 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
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SCGB2A2Q13296 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
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SCGB2A2Q13296 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SCGB2A2Q13296 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SCGB2A2Q13296 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
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SCGB2A2Q13296 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SCGB2A2Q13296 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SCGB2A2Q13296 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCGB2A2Q13296 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCGB2A2Q13296 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCGB2A2Q13296 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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SCGB2A2Q13296 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCGB2A2Q13296 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCGB2A2Q13296 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCGB2A2Q13296 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCGB2A2Q13296 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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SCGB2A2Q13296 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCGB2A2Q13296 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCGB2A2Q13296 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCGB2A2Q13296 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCGB2A2Q13296 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCGB2A2Q13296 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCGB2A2Q13296 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCGB2A2Q13296 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCGB2A2Q13296 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCGB2A2Q13296 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCGB2A2Q13296 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCGB2A2Q13296 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCGB2A2Q13296 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCGB2A2Q13296 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCGB2A2Q13296 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCGB2A2Q13296 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCGB2A2Q13296 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SCGB2A2Q13296 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCGB2A2Q13296 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
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