Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERCC8Q13216 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERCC8Q13216 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERCC8Q13216 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERCC8Q13216 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERCC8Q13216 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERCC8Q13216 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERCC8Q13216 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ERCC8Q13216 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERCC8Q13216 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERCC8Q13216 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERCC8Q13216 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERCC8Q13216 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERCC8Q13216 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERCC8Q13216 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERCC8Q13216 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERCC8Q13216 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERCC8Q13216 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERCC8Q13216 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERCC8Q13216 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ERCC8Q13216 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERCC8Q13216 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERCC8Q13216 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERCC8Q13216 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERCC8Q13216 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERCC8Q13216 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ERCC8Q13216 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
ERCC8Q13216 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ERCC8Q13216 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERCC8Q13216 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERCC8Q13216 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERCC8Q13216 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERCC8Q13216 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERCC8Q13216 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERCC8Q13216 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERCC8Q13216 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERCC8Q13216 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERCC8Q13216 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERCC8Q13216 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERCC8Q13216 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERCC8Q13216 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERCC8Q13216 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERCC8Q13216 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERCC8Q13216 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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ERCC8Q13216 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERCC8Q13216 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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ERCC8Q13216 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERCC8Q13216 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ERCC8Q13216 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERCC8Q13216 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERCC8Q13216 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERCC8Q13216 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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ERCC8Q13216 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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ERCC8Q13216 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERCC8Q13216 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERCC8Q13216 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERCC8Q13216 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERCC8Q13216 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERCC8Q13216 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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ERCC8Q13216 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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ERCC8Q13216 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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ERCC8Q13216 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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ERCC8Q13216 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERCC8Q13216 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERCC8Q13216 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERCC8Q13216 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERCC8Q13216 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERCC8Q13216 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERCC8Q13216 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERCC8Q13216 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERCC8Q13216 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERCC8Q13216 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERCC8Q13216 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERCC8Q13216 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERCC8Q13216 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERCC8Q13216 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERCC8Q13216 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERCC8Q13216 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ERCC8Q13216 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ERCC8Q13216 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERCC8Q13216 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERCC8Q13216 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERCC8Q13216 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERCC8Q13216 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERCC8Q13216 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERCC8Q13216 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERCC8Q13216 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERCC8Q13216 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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