Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPS1Q13098 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GPS1Q13098 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GPS1Q13098 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GPS1Q13098 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GPS1Q13098 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GPS1Q13098 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GPS1Q13098 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GPS1Q13098 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GPS1Q13098 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GPS1Q13098 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GPS1Q13098 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GPS1Q13098 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GPS1Q13098 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GPS1Q13098 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GPS1Q13098 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPS1Q13098 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPS1Q13098 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPS1Q13098 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPS1Q13098 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPS1Q13098 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPS1Q13098 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPS1Q13098 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPS1Q13098 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPS1Q13098 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPS1Q13098 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPS1Q13098 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GPS1Q13098 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPS1Q13098 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPS1Q13098 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPS1Q13098 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPS1Q13098 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPS1Q13098 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPS1Q13098 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPS1Q13098 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPS1Q13098 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPS1Q13098 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPS1Q13098 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPS1Q13098 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPS1Q13098 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPS1Q13098 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPS1Q13098 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPS1Q13098 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GPS1Q13098 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GPS1Q13098 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GPS1Q13098 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GPS1Q13098 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GPS1Q13098 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GPS1Q13098 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GPS1Q13098 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GPS1Q13098 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GPS1Q13098 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GPS1Q13098 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GPS1Q13098 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GPS1Q13098 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPS1Q13098 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPS1Q13098 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPS1Q13098 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPS1Q13098 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPS1Q13098 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPS1Q13098 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPS1Q13098 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPS1Q13098 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GPS1Q13098 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPS1Q13098 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GPS1Q13098 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPS1Q13098 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPS1Q13098 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPS1Q13098 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPS1Q13098 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPS1Q13098 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GPS1Q13098 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GPS1Q13098 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GPS1Q13098 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GPS1Q13098 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GPS1Q13098 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GPS1Q13098 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GPS1Q13098 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GPS1Q13098 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GPS1Q13098 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GPS1Q13098 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GPS1Q13098 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GPS1Q13098 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GPS1Q13098 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GPS1Q13098 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPS1Q13098 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPS1Q13098 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPS1Q13098 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPS1Q13098 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPS1Q13098 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPS1Q13098 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPS1Q13098 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPS1Q13098 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPS1Q13098 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPS1Q13098 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPS1Q13098 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
GPS1Q13098 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPS1Q13098 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPS1Q13098 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPS1Q13098 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
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