Protein–RNA interactions for Protein: Q12266

TY1A-BL, Transposon Ty1-BL Gag polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-BLQ12266 SDH7YDR511W 402 nt5.22□□□□□ -1.57
TY1A-BLQ12266 YGR053CYGR053C 852 nt5.22□□□□□ -1.57
TY1A-BLQ12266 NBL1YHR199C-A 222 nt5.22□□□□□ -1.57
TY1A-BLQ12266 REE1YJL217W 597 nt5.22□□□□□ -1.57
TY1A-BLQ12266 YLL044WYLL044W 447 nt5.22□□□□□ -1.57
TY1A-BLQ12266 CDC42YLR229C 576 nt5.22□□□□□ -1.57
TY1A-BLQ12266 YLR269CYLR269C 351 nt5.22□□□□□ -1.57
TY1A-BLQ12266 YLR302CYLR302C 363 nt5.22□□□□□ -1.57
TY1A-BLQ12266 MED11YMR112C 396 nt5.22□□□□□ -1.57
TY1A-BLQ12266 SSN8YNL025C 972 nt5.22□□□□□ -1.57
TY1A-BLQ12266 MRPS5YBR251W 924 nt5.22□□□□□ -1.57
TY1A-BLQ12266 SUP35YDR172W 2058 nt5.22□□□□□ -1.57
TY1A-BLQ12266 GPA2YER020W 1350 nt5.21□□□□□ -1.58
TY1A-BLQ12266 VPS33YLR396C 2076 nt5.21□□□□□ -1.58
TY1A-BLQ12266 VPS70YJR126C 2436 nt5.21□□□□□ -1.58
TY1A-BLQ12266 TDH3YGR192C 999 nt5.21□□□□□ -1.58
TY1A-BLQ12266 DPH1YIL103W 1278 nt5.21□□□□□ -1.58
TY1A-BLQ12266 RPA34YJL148W 702 nt5.21□□□□□ -1.58
TY1A-BLQ12266 SHE2YKL130C 741 nt5.21□□□□□ -1.58
TY1A-BLQ12266 ESF2YNR054C 951 nt5.21□□□□□ -1.58
TY1A-BLQ12266 PDX3YBR035C 687 nt5.21□□□□□ -1.58
TY1A-BLQ12266 YPL135C-AYPL135C-A 174 nt5.21□□□□□ -1.58
TY1A-BLQ12266 MAL33YBR297W 1407 nt5.21□□□□□ -1.58
TY1A-BLQ12266 GPB2YAL056W 2643 nt5.21□□□□□ -1.58
TY1A-BLQ12266 HRD1YOL013C 1656 nt5.21□□□□□ -1.58
TY1A-BLQ12266 SCT1YBL011W 2280 nt5.21□□□□□ -1.58
TY1A-BLQ12266 ZUO1YGR285C 1302 nt5.21□□□□□ -1.58
TY1A-BLQ12266 TUB3YML124C 1338 nt5.21□□□□□ -1.58
TY1A-BLQ12266 PAC1YOR269W 1485 nt5.2□□□□□ -1.58
TY1A-BLQ12266 AIM14YGL160W 1713 nt5.2□□□□□ -1.58
TY1A-BLQ12266 NDT80YHR124W 1884 nt5.2□□□□□ -1.58
TY1A-BLQ12266 MUB1YMR100W 1863 nt5.2□□□□□ -1.58
TY1A-BLQ12266 MMT1YMR177W 1533 nt5.2□□□□□ -1.58
TY1A-BLQ12266 RPB9YGL070C 369 nt5.2□□□□□ -1.58
TY1A-BLQ12266 RPS2YGL123W 765 nt5.2□□□□□ -1.58
TY1A-BLQ12266 SPG1YGR236C 288 nt5.2□□□□□ -1.58
TY1A-BLQ12266 RPL19BYBL027W 570 nt5.2□□□□□ -1.58
TY1A-BLQ12266 CIN4YMR138W 576 nt5.2□□□□□ -1.58
TY1A-BLQ12266 NOP15YNL110C 663 nt5.2□□□□□ -1.58
TY1A-BLQ12266 TRM112YNR046W 408 nt5.2□□□□□ -1.58
TY1A-BLQ12266 TAF14YPL129W 735 nt5.2□□□□□ -1.58
TY1A-BLQ12266 FRM2YCL026C-A 582 nt5.2□□□□□ -1.58
TY1A-BLQ12266 NDD1YOR372C 1665 nt5.2□□□□□ -1.58
TY1A-BLQ12266 TAX4YJL083W 1815 nt5.2□□□□□ -1.58
TY1A-BLQ12266 YDR109CYDR109C 2148 nt5.2□□□□□ -1.58
TY1A-BLQ12266 RRN11YML043C 1524 nt5.19□□□□□ -1.58
TY1A-BLQ12266 MKK2YPL140C 1521 nt5.19□□□□□ -1.58
TY1A-BLQ12266 EIS1YMR031C 2532 nt5.19□□□□□ -1.58
TY1A-BLQ12266 YCR097W-AYCR097W-A 267 nt5.19□□□□□ -1.58
TY1A-BLQ12266 IDP1YDL066W 1287 nt5.19□□□□□ -1.58
TY1A-BLQ12266 VMA10YHR039C-A 345 nt5.19□□□□□ -1.58
TY1A-BLQ12266 APQ12YIL040W 417 nt5.19□□□□□ -1.58
TY1A-BLQ12266 RPS24BYIL069C 408 nt5.19□□□□□ -1.58
TY1A-BLQ12266 YLR157W-EYLR157W-E 165 nt5.19□□□□□ -1.58
TY1A-BLQ12266 GSY2YLR258W 2118 nt5.19□□□□□ -1.58
TY1A-BLQ12266 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt5.19□□□□□ -1.58
TY1A-BLQ12266 YOR131CYOR131C 657 nt5.19□□□□□ -1.58
TY1A-BLQ12266 FLC3YGL139W 2409 nt5.19□□□□□ -1.58
TY1A-BLQ12266 APE3YBR286W 1614 nt5.19□□□□□ -1.58
TY1A-BLQ12266 FHL1YPR104C 2811 nt5.19□□□□□ -1.58
TY1A-BLQ12266 MEF1YLR069C 2286 nt5.18□□□□□ -1.58
TY1A-BLQ12266 STE7YDL159W 1548 nt5.18□□□□□ -1.58
TY1A-BLQ12266 VHR2YER064C 1518 nt5.18□□□□□ -1.58
TY1A-BLQ12266 YJR003CYJR003C 1560 nt5.18□□□□□ -1.58
TY1A-BLQ12266 YDR115WYDR115W 318 nt5.18□□□□□ -1.58
TY1A-BLQ12266 VOA1YGR106C 798 nt5.18□□□□□ -1.58
TY1A-BLQ12266 SUP19tS(UGA)E 82 nt5.18□□□□□ -1.58
TY1A-BLQ12266 SUP17tS(UGA)I 82 nt5.18□□□□□ -1.58
TY1A-BLQ12266 SUP16tS(UGA)P 82 nt5.18□□□□□ -1.58
TY1A-BLQ12266 YJR012CYJR012C 624 nt5.18□□□□□ -1.58
TY1A-BLQ12266 MOG1YJR074W 657 nt5.18□□□□□ -1.58
TY1A-BLQ12266 FCF2YLR051C 654 nt5.18□□□□□ -1.58
TY1A-BLQ12266 RPP0YLR340W 939 nt5.18□□□□□ -1.58
TY1A-BLQ12266 FSH3YOR280C 801 nt5.18□□□□□ -1.58
TY1A-BLQ12266 YPS7YDR349C 1791 nt5.17□□□□□ -1.58
TY1A-BLQ12266 CDC4YFL009W 2340 nt5.17□□□□□ -1.58
TY1A-BLQ12266 CLA4YNL298W 2529 nt5.17□□□□□ -1.58
TY1A-BLQ12266 MPC3YGR243W 441 nt5.17□□□□□ -1.58
TY1A-BLQ12266 RSM25YIL093C 795 nt5.17□□□□□ -1.58
TY1A-BLQ12266 MRPL38YKL170W 417 nt5.17□□□□□ -1.58
TY1A-BLQ12266 YKL223WYKL223W 333 nt5.17□□□□□ -1.58
TY1A-BLQ12266 UBC11YOR339C 471 nt5.17□□□□□ -1.58
TY1A-BLQ12266 NUG1YER006W 1563 nt5.16□□□□□ -1.58
TY1A-BLQ12266 ENT2YLR206W 1842 nt5.16□□□□□ -1.58
TY1A-BLQ12266 QDR3YBR043C 2070 nt5.16□□□□□ -1.58
TY1A-BLQ12266 RIM101YHL027W 1878 nt5.16□□□□□ -1.58
TY1A-BLQ12266 TRS65YGR166W 1683 nt5.16□□□□□ -1.58
TY1A-BLQ12266 OCT1YKL134C 2319 nt5.16□□□□□ -1.58
TY1A-BLQ12266 PRP11YDL043C 801 nt5.16□□□□□ -1.58
TY1A-BLQ12266 MTM1YGR257C 1101 nt5.16□□□□□ -1.58
TY1A-BLQ12266 YHL048C-AYHL048C-A 135 nt5.16□□□□□ -1.58
TY1A-BLQ12266 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt5.16□□□□□ -1.58
TY1A-BLQ12266 STM1YLR150W 822 nt5.16□□□□□ -1.58
TY1A-BLQ12266 SUE1YPR151C 621 nt5.16□□□□□ -1.58
TY1A-BLQ12266 MPH2YDL247W 1830 nt5.16□□□□□ -1.58
TY1A-BLQ12266 YRF1-4YLR466W 4149 nt5.16□□□□□ -1.58
TY1A-BLQ12266 MID1YNL291C 1647 nt5.15□□□□□ -1.58
TY1A-BLQ12266 ARP5YNL059C 2268 nt5.15□□□□□ -1.58
TY1A-BLQ12266 COA4YLR218C 453 nt5.15□□□□□ -1.59
TY1A-BLQ12266 YAR075WYAR075W 474 nt5.15□□□□□ -1.59
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