Protein–RNA interactions for Protein: Q09428

ABCC8, ATP-binding cassette sub-family C member 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC8Q09428 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
ABCC8Q09428 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
ABCC8Q09428 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
ABCC8Q09428 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
ABCC8Q09428 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
ABCC8Q09428 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
ABCC8Q09428 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
ABCC8Q09428 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC36.51■■■■□ 3.44
ABCC8Q09428 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.44
ABCC8Q09428 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.44
ABCC8Q09428 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
ABCC8Q09428 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
ABCC8Q09428 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
ABCC8Q09428 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
ABCC8Q09428 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
ABCC8Q09428 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
ABCC8Q09428 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
ABCC8Q09428 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
ABCC8Q09428 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC36.5■■■■□ 3.43
ABCC8Q09428 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
ABCC8Q09428 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
ABCC8Q09428 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
ABCC8Q09428 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
ABCC8Q09428 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
ABCC8Q09428 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
ABCC8Q09428 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
ABCC8Q09428 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
ABCC8Q09428 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
ABCC8Q09428 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
ABCC8Q09428 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
ABCC8Q09428 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
ABCC8Q09428 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
ABCC8Q09428 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC36.49■■■■□ 3.43
ABCC8Q09428 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
ABCC8Q09428 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
ABCC8Q09428 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
ABCC8Q09428 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
ABCC8Q09428 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
ABCC8Q09428 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
ABCC8Q09428 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
ABCC8Q09428 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC36.48■■■■□ 3.43
ABCC8Q09428 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
ABCC8Q09428 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
ABCC8Q09428 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC36.47■■■■□ 3.43
ABCC8Q09428 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC36.47■■■■□ 3.43
ABCC8Q09428 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC36.47■■■■□ 3.43
ABCC8Q09428 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
ABCC8Q09428 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
ABCC8Q09428 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
ABCC8Q09428 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
ABCC8Q09428 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
ABCC8Q09428 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
ABCC8Q09428 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
ABCC8Q09428 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC36.47■■■■□ 3.43
ABCC8Q09428 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
ABCC8Q09428 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
ABCC8Q09428 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
ABCC8Q09428 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
ABCC8Q09428 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC36.46■■■■□ 3.43
ABCC8Q09428 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC36.46■■■■□ 3.43
ABCC8Q09428 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
ABCC8Q09428 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
ABCC8Q09428 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
ABCC8Q09428 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
ABCC8Q09428 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
ABCC8Q09428 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
ABCC8Q09428 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
ABCC8Q09428 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
ABCC8Q09428 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC36.45■■■■□ 3.43
ABCC8Q09428 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
ABCC8Q09428 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
ABCC8Q09428 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
ABCC8Q09428 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
ABCC8Q09428 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
ABCC8Q09428 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
ABCC8Q09428 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
ABCC8Q09428 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
ABCC8Q09428 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
ABCC8Q09428 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
ABCC8Q09428 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
ABCC8Q09428 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
ABCC8Q09428 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
ABCC8Q09428 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
ABCC8Q09428 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
ABCC8Q09428 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
ABCC8Q09428 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
ABCC8Q09428 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
ABCC8Q09428 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
ABCC8Q09428 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
ABCC8Q09428 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
ABCC8Q09428 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
ABCC8Q09428 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
ABCC8Q09428 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
ABCC8Q09428 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
ABCC8Q09428 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
ABCC8Q09428 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
ABCC8Q09428 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
ABCC8Q09428 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
ABCC8Q09428 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
ABCC8Q09428 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms