Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCN1BQ07699 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SCN1BQ07699 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SCN1BQ07699 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCN1BQ07699 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCN1BQ07699 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCN1BQ07699 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCN1BQ07699 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCN1BQ07699 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCN1BQ07699 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCN1BQ07699 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCN1BQ07699 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCN1BQ07699 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCN1BQ07699 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCN1BQ07699 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCN1BQ07699 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCN1BQ07699 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCN1BQ07699 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCN1BQ07699 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCN1BQ07699 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCN1BQ07699 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCN1BQ07699 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCN1BQ07699 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCN1BQ07699 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCN1BQ07699 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCN1BQ07699 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCN1BQ07699 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCN1BQ07699 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCN1BQ07699 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCN1BQ07699 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCN1BQ07699 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCN1BQ07699 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCN1BQ07699 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCN1BQ07699 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCN1BQ07699 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCN1BQ07699 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCN1BQ07699 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCN1BQ07699 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCN1BQ07699 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCN1BQ07699 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCN1BQ07699 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCN1BQ07699 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCN1BQ07699 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCN1BQ07699 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCN1BQ07699 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms