Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRCDQ00LT1 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms