Protein–RNA interactions for Protein: P98196

ATP11A, Probable phospholipid-transporting ATPase IH, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP11AP98196 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP11AP98196 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP11AP98196 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP11AP98196 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP11AP98196 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP11AP98196 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP11AP98196 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP11AP98196 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP11AP98196 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP11AP98196 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP11AP98196 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP11AP98196 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP11AP98196 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP11AP98196 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP11AP98196 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP11AP98196 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP11AP98196 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP11AP98196 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP11AP98196 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP11AP98196 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP11AP98196 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP11AP98196 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP11AP98196 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP11AP98196 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP11AP98196 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP11AP98196 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP11AP98196 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP11AP98196 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP11AP98196 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP11AP98196 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP11AP98196 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP11AP98196 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP11AP98196 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP11AP98196 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP11AP98196 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP11AP98196 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP11AP98196 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP11AP98196 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP11AP98196 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP11AP98196 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP11AP98196 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP11AP98196 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP11AP98196 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP11AP98196 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP11AP98196 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP11AP98196 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP11AP98196 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP11AP98196 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP11AP98196 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP11AP98196 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP11AP98196 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP11AP98196 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP11AP98196 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP11AP98196 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP11AP98196 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP11AP98196 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP11AP98196 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP11AP98196 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP11AP98196 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP11AP98196 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP11AP98196 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP11AP98196 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP11AP98196 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP11AP98196 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP11AP98196 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP11AP98196 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP11AP98196 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP11AP98196 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP11AP98196 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP11AP98196 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP11AP98196 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP11AP98196 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP11AP98196 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP11AP98196 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP11AP98196 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP11AP98196 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP11AP98196 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP11AP98196 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP11AP98196 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP11AP98196 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP11AP98196 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP11AP98196 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP11AP98196 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP11AP98196 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP11AP98196 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP11AP98196 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP11AP98196 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP11AP98196 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP11AP98196 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP11AP98196 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP11AP98196 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP11AP98196 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP11AP98196 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP11AP98196 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP11AP98196 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP11AP98196 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP11AP98196 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP11AP98196 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP11AP98196 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP11AP98196 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms