Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UFM1P61960 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
UFM1P61960 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UFM1P61960 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UFM1P61960 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UFM1P61960 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UFM1P61960 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UFM1P61960 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UFM1P61960 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
UFM1P61960 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UFM1P61960 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
UFM1P61960 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
UFM1P61960 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
UFM1P61960 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UFM1P61960 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UFM1P61960 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UFM1P61960 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UFM1P61960 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
UFM1P61960 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UFM1P61960 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UFM1P61960 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UFM1P61960 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
UFM1P61960 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UFM1P61960 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
UFM1P61960 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
UFM1P61960 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
UFM1P61960 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
UFM1P61960 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
UFM1P61960 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
UFM1P61960 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UFM1P61960 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UFM1P61960 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UFM1P61960 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
UFM1P61960 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
UFM1P61960 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
UFM1P61960 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UFM1P61960 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
UFM1P61960 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UFM1P61960 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UFM1P61960 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UFM1P61960 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UFM1P61960 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
UFM1P61960 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UFM1P61960 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
UFM1P61960 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
UFM1P61960 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
UFM1P61960 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
UFM1P61960 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UFM1P61960 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UFM1P61960 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UFM1P61960 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UFM1P61960 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UFM1P61960 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
UFM1P61960 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
UFM1P61960 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
UFM1P61960 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UFM1P61960 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UFM1P61960 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UFM1P61960 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
UFM1P61960 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UFM1P61960 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UFM1P61960 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UFM1P61960 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UFM1P61960 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UFM1P61960 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UFM1P61960 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UFM1P61960 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UFM1P61960 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UFM1P61960 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UFM1P61960 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UFM1P61960 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UFM1P61960 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UFM1P61960 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UFM1P61960 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UFM1P61960 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UFM1P61960 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UFM1P61960 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UFM1P61960 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UFM1P61960 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UFM1P61960 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UFM1P61960 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UFM1P61960 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UFM1P61960 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UFM1P61960 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UFM1P61960 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UFM1P61960 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UFM1P61960 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
UFM1P61960 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UFM1P61960 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UFM1P61960 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UFM1P61960 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UFM1P61960 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UFM1P61960 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
UFM1P61960 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UFM1P61960 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UFM1P61960 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UFM1P61960 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UFM1P61960 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UFM1P61960 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UFM1P61960 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms