Protein–RNA interactions for Protein: P61018

RAB4B, Ras-related protein Rab-4B, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4BP61018 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB4BP61018 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB4BP61018 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB4BP61018 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB4BP61018 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB4BP61018 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB4BP61018 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB4BP61018 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB4BP61018 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB4BP61018 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB4BP61018 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB4BP61018 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB4BP61018 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB4BP61018 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB4BP61018 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB4BP61018 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB4BP61018 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB4BP61018 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB4BP61018 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB4BP61018 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB4BP61018 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB4BP61018 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB4BP61018 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB4BP61018 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB4BP61018 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB4BP61018 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB4BP61018 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB4BP61018 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB4BP61018 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB4BP61018 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB4BP61018 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB4BP61018 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB4BP61018 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB4BP61018 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB4BP61018 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB4BP61018 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB4BP61018 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB4BP61018 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB4BP61018 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB4BP61018 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB4BP61018 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB4BP61018 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB4BP61018 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB4BP61018 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB4BP61018 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB4BP61018 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB4BP61018 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB4BP61018 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB4BP61018 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB4BP61018 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB4BP61018 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB4BP61018 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB4BP61018 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB4BP61018 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB4BP61018 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB4BP61018 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB4BP61018 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB4BP61018 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB4BP61018 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB4BP61018 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB4BP61018 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB4BP61018 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB4BP61018 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB4BP61018 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB4BP61018 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB4BP61018 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB4BP61018 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB4BP61018 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB4BP61018 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB4BP61018 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB4BP61018 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB4BP61018 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB4BP61018 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB4BP61018 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB4BP61018 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB4BP61018 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB4BP61018 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB4BP61018 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB4BP61018 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB4BP61018 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB4BP61018 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB4BP61018 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB4BP61018 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB4BP61018 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB4BP61018 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB4BP61018 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB4BP61018 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB4BP61018 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB4BP61018 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB4BP61018 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB4BP61018 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB4BP61018 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB4BP61018 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB4BP61018 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB4BP61018 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB4BP61018 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB4BP61018 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB4BP61018 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB4BP61018 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB4BP61018 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms