Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCCD1P59942 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCCD1P59942 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCCD1P59942 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MCCD1P59942 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MCCD1P59942 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MCCD1P59942 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MCCD1P59942 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MCCD1P59942 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MCCD1P59942 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MCCD1P59942 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MCCD1P59942 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MCCD1P59942 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MCCD1P59942 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MCCD1P59942 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MCCD1P59942 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MCCD1P59942 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MCCD1P59942 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCCD1P59942 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCCD1P59942 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCCD1P59942 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCCD1P59942 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCCD1P59942 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MCCD1P59942 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCCD1P59942 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCCD1P59942 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCCD1P59942 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCCD1P59942 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCCD1P59942 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCCD1P59942 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCCD1P59942 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCCD1P59942 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCCD1P59942 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCCD1P59942 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCCD1P59942 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCCD1P59942 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCCD1P59942 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCCD1P59942 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCCD1P59942 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCCD1P59942 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MCCD1P59942 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCCD1P59942 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCCD1P59942 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCCD1P59942 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCCD1P59942 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCCD1P59942 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCCD1P59942 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCCD1P59942 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCCD1P59942 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCCD1P59942 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCCD1P59942 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCCD1P59942 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCCD1P59942 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCCD1P59942 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCCD1P59942 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MCCD1P59942 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MCCD1P59942 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MCCD1P59942 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MCCD1P59942 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCCD1P59942 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCCD1P59942 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCCD1P59942 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCCD1P59942 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCCD1P59942 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCCD1P59942 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCCD1P59942 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCCD1P59942 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCCD1P59942 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCCD1P59942 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCCD1P59942 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCCD1P59942 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCCD1P59942 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCCD1P59942 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCCD1P59942 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCCD1P59942 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCCD1P59942 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCCD1P59942 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCCD1P59942 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCCD1P59942 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCCD1P59942 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCCD1P59942 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCCD1P59942 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MCCD1P59942 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCCD1P59942 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCCD1P59942 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCCD1P59942 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MCCD1P59942 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MCCD1P59942 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MCCD1P59942 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MCCD1P59942 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCCD1P59942 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCCD1P59942 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCCD1P59942 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCCD1P59942 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCCD1P59942 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCCD1P59942 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCCD1P59942 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCCD1P59942 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCCD1P59942 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCCD1P59942 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms