Protein–RNA interactions for Protein: P55327

TPD52, Tumor protein D52, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52P55327 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TPD52P55327 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TPD52P55327 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TPD52P55327 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TPD52P55327 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TPD52P55327 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TPD52P55327 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TPD52P55327 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TPD52P55327 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TPD52P55327 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TPD52P55327 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TPD52P55327 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TPD52P55327 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TPD52P55327 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TPD52P55327 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TPD52P55327 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TPD52P55327 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TPD52P55327 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TPD52P55327 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TPD52P55327 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TPD52P55327 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TPD52P55327 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TPD52P55327 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TPD52P55327 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TPD52P55327 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TPD52P55327 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TPD52P55327 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TPD52P55327 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TPD52P55327 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TPD52P55327 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TPD52P55327 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TPD52P55327 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TPD52P55327 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TPD52P55327 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TPD52P55327 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TPD52P55327 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TPD52P55327 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TPD52P55327 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TPD52P55327 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TPD52P55327 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TPD52P55327 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TPD52P55327 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TPD52P55327 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TPD52P55327 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TPD52P55327 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TPD52P55327 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TPD52P55327 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TPD52P55327 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TPD52P55327 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TPD52P55327 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TPD52P55327 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TPD52P55327 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TPD52P55327 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TPD52P55327 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TPD52P55327 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TPD52P55327 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TPD52P55327 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TPD52P55327 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TPD52P55327 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TPD52P55327 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TPD52P55327 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TPD52P55327 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TPD52P55327 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TPD52P55327 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TPD52P55327 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TPD52P55327 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TPD52P55327 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPD52P55327 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPD52P55327 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPD52P55327 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPD52P55327 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPD52P55327 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPD52P55327 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPD52P55327 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPD52P55327 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPD52P55327 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPD52P55327 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPD52P55327 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPD52P55327 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPD52P55327 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPD52P55327 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPD52P55327 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPD52P55327 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPD52P55327 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPD52P55327 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPD52P55327 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPD52P55327 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPD52P55327 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPD52P55327 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPD52P55327 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPD52P55327 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPD52P55327 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPD52P55327 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPD52P55327 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPD52P55327 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPD52P55327 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPD52P55327 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPD52P55327 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPD52P55327 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPD52P55327 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms