Protein–RNA interactions for Protein: P54920

NAPA, Alpha-soluble NSF attachment protein, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAPAP54920 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NAPAP54920 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NAPAP54920 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NAPAP54920 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NAPAP54920 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NAPAP54920 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NAPAP54920 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NAPAP54920 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NAPAP54920 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NAPAP54920 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NAPAP54920 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NAPAP54920 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NAPAP54920 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NAPAP54920 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NAPAP54920 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NAPAP54920 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NAPAP54920 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NAPAP54920 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NAPAP54920 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NAPAP54920 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NAPAP54920 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NAPAP54920 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NAPAP54920 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NAPAP54920 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NAPAP54920 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NAPAP54920 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NAPAP54920 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NAPAP54920 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NAPAP54920 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NAPAP54920 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NAPAP54920 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NAPAP54920 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NAPAP54920 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NAPAP54920 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NAPAP54920 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NAPAP54920 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NAPAP54920 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NAPAP54920 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NAPAP54920 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NAPAP54920 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NAPAP54920 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NAPAP54920 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NAPAP54920 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NAPAP54920 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NAPAP54920 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NAPAP54920 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NAPAP54920 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NAPAP54920 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NAPAP54920 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NAPAP54920 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NAPAP54920 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NAPAP54920 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NAPAP54920 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NAPAP54920 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NAPAP54920 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NAPAP54920 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NAPAP54920 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NAPAP54920 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NAPAP54920 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NAPAP54920 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NAPAP54920 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NAPAP54920 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NAPAP54920 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NAPAP54920 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NAPAP54920 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NAPAP54920 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NAPAP54920 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NAPAP54920 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NAPAP54920 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NAPAP54920 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NAPAP54920 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NAPAP54920 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NAPAP54920 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NAPAP54920 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NAPAP54920 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NAPAP54920 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NAPAP54920 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NAPAP54920 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NAPAP54920 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NAPAP54920 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NAPAP54920 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NAPAP54920 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NAPAP54920 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NAPAP54920 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NAPAP54920 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NAPAP54920 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NAPAP54920 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NAPAP54920 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NAPAP54920 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NAPAP54920 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NAPAP54920 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NAPAP54920 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NAPAP54920 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NAPAP54920 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NAPAP54920 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NAPAP54920 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NAPAP54920 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NAPAP54920 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NAPAP54920 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NAPAP54920 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms