Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF2A2P52657 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF2A2P52657 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF2A2P52657 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF2A2P52657 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF2A2P52657 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF2A2P52657 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF2A2P52657 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF2A2P52657 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF2A2P52657 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF2A2P52657 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF2A2P52657 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF2A2P52657 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF2A2P52657 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF2A2P52657 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF2A2P52657 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF2A2P52657 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF2A2P52657 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF2A2P52657 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF2A2P52657 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF2A2P52657 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF2A2P52657 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF2A2P52657 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF2A2P52657 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF2A2P52657 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF2A2P52657 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF2A2P52657 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF2A2P52657 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF2A2P52657 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF2A2P52657 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF2A2P52657 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF2A2P52657 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF2A2P52657 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF2A2P52657 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF2A2P52657 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF2A2P52657 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF2A2P52657 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF2A2P52657 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF2A2P52657 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF2A2P52657 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF2A2P52657 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF2A2P52657 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF2A2P52657 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF2A2P52657 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF2A2P52657 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF2A2P52657 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF2A2P52657 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF2A2P52657 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF2A2P52657 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF2A2P52657 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF2A2P52657 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF2A2P52657 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF2A2P52657 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF2A2P52657 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF2A2P52657 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF2A2P52657 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF2A2P52657 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF2A2P52657 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GTF2A2P52657 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GTF2A2P52657 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GTF2A2P52657 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GTF2A2P52657 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GTF2A2P52657 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GTF2A2P52657 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GTF2A2P52657 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
GTF2A2P52657 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GTF2A2P52657 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GTF2A2P52657 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GTF2A2P52657 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF2A2P52657 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF2A2P52657 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF2A2P52657 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF2A2P52657 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF2A2P52657 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF2A2P52657 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF2A2P52657 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF2A2P52657 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF2A2P52657 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF2A2P52657 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF2A2P52657 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF2A2P52657 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF2A2P52657 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF2A2P52657 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF2A2P52657 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF2A2P52657 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF2A2P52657 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF2A2P52657 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF2A2P52657 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF2A2P52657 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF2A2P52657 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF2A2P52657 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF2A2P52657 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF2A2P52657 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF2A2P52657 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF2A2P52657 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF2A2P52657 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF2A2P52657 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF2A2P52657 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF2A2P52657 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF2A2P52657 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms