Protein–RNA interactions for Protein: P52272

HNRNPM, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein M, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPMP52272 RPL10-203ENST00000406022 748 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.967e-9■■■■■ 27.6
HNRNPMP52272 RPL10-215ENST00000489200 1519 ntTSL 220.22■□□□□ 0.833e-7■■■■■ 27.6
HNRNPMP52272 RPL10-214ENST00000485196 839 ntTSL 219.08■□□□□ 0.643e-7■■■■■ 27.6
HNRNPMP52272 RPL10-207ENST00000436473 657 ntTSL 218.19■□□□□ 0.53e-7■■■■■ 27.6
HNRNPMP52272 RPL10-218ENST00000618723 2210 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.433e-7■■■■■ 27.6
HNRNPMP52272 RPL10-211ENST00000467168 802 ntTSL 217.22■□□□□ 0.353e-7■■■■■ 27.6
HNRNPMP52272 RPL10-216ENST00000491035 1369 ntTSL 516.71■□□□□ 0.273e-7■■■■■ 27.6
HNRNPMP52272 RPL10-204ENST00000424325 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.213e-7■■■■■ 27.6
HNRNPMP52272 RPL10-213ENST00000482732 1731 ntTSL 1 (best)16.09■□□□□ 0.173e-7■■■■■ 27.6
HNRNPMP52272 RPL10-201ENST00000344746 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best)14.21□□□□□ -0.133e-7■■■■■ 27.6
HNRNPMP52272 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.173e-7■■■■■ 27.6
HNRNPMP52272 TMEM245-205ENST00000491854 2435 ntTSL 29.77□□□□□ -0.853e-7■■■■■ 27.6
HNRNPMP52272 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.672e-8■■■■■ 27.6
HNRNPMP52272 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.896e-8■■■■■ 27.6
HNRNPMP52272 RBM12-202ENST00000374104 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.026e-8■■■■■ 27.6
HNRNPMP52272 RBM12-203ENST00000374114 6662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.646e-8■■■■■ 27.6
HNRNPMP52272 GPATCH2L-205ENST00000554375 1791 ntTSL 526.51■■□□□ 1.834e-8■■■■■ 27.5
HNRNPMP52272 GPATCH2L-202ENST00000312858 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.864e-8■■■■■ 27.5
HNRNPMP52272 GPATCH2L-210ENST00000556675 771 ntTSL 316.66■□□□□ 0.264e-8■■■■■ 27.5
HNRNPMP52272 GPATCH2L-206ENST00000554799 821 ntTSL 514.68□□□□□ -0.064e-8■■■■■ 27.5
HNRNPMP52272 GPATCH2L-203ENST00000553588 776 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.024e-8■■■■■ 27.5
HNRNPMP52272 GPATCH2L-201ENST00000261530 14007 ntTSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.074e-8■■■■■ 27.5
HNRNPMP52272 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.464e-8■■■■■ 27.5
HNRNPMP52272 SIK3-211ENST00000485363 764 ntTSL 1 (best)25.32■■□□□ 1.649e-7■■■■■ 27.5
HNRNPMP52272 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.99e-7■■■■■ 27.5
HNRNPMP52272 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.559e-7■■■■■ 27.5
HNRNPMP52272 SIK3-204ENST00000445177 6331 ntAPPRIS ALT2 TSL 517.72■□□□□ 0.439e-7■■■■■ 27.5
HNRNPMP52272 SIK3-203ENST00000415541 3816 ntTSL 1 (best)10.48□□□□□ -0.739e-7■■■■■ 27.5
HNRNPMP52272 MCM7-206ENST00000465688 481 ntTSL 328.89■■■□□ 2.226e-8■■■■■ 27.5
HNRNPMP52272 OSBPL8-214ENST00000551927 531 ntTSL 224.52■■□□□ 1.526e-8■■■■■ 27.5
HNRNPMP52272 OSBPL8-206ENST00000547544 363 ntTSL 323.56■■□□□ 1.366e-8■■■■■ 27.5
HNRNPMP52272 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.116e-8■■■■■ 27.5
HNRNPMP52272 MCM7-205ENST00000463722 1327 ntTSL 517.47■□□□□ 0.396e-8■■■■■ 27.5
HNRNPMP52272 MCM7-213ENST00000621318 3084 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.266e-8■■■■■ 27.5
HNRNPMP52272 MCM7-201ENST00000303887 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.236e-8■■■■■ 27.5
HNRNPMP52272 OSBPL8-215ENST00000552178 269 ntTSL 316.34■□□□□ 0.216e-8■■■■■ 27.5
HNRNPMP52272 MCM7-210ENST00000489841 2515 ntTSL 1 (best)13.42□□□□□ -0.266e-8■■■■■ 27.5
HNRNPMP52272 GRB10-223ENST00000492265 447 ntTSL 36.79□□□□□ -1.322e-7■■■■■ 27.5
HNRNPMP52272 NUTM2B-AS1-209ENST00000596088 366 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.684e-7■■■■■ 27.5
HNRNPMP52272 NUTM2B-AS1-210ENST00000600376 510 ntTSL 37.25□□□□□ -1.254e-7■■■■■ 27.5
HNRNPMP52272 ACER3-214ENST00000534206 834 ntTSL 545.82■■■■■ 4.931e-6■■■■■ 27.5
HNRNPMP52272 ACER3-211ENST00000531461 1292 ntTSL 238.66■■■■□ 3.781e-6■■■■■ 27.5
HNRNPMP52272 ACER3-207ENST00000530182 551 ntTSL 538.48■■■■□ 3.751e-6■■■■■ 27.5
HNRNPMP52272 ACER3-204ENST00000525861 2058 ntTSL 233.97■■■■□ 3.031e-6■■■■■ 27.5
HNRNPMP52272 ACER3-202ENST00000525194 846 ntTSL 1 (best)33.19■■■□□ 2.91e-6■■■■■ 27.5
HNRNPMP52272 SIL1-215ENST00000515008 843 ntTSL 328.09■■■□□ 2.093e-7■■■■■ 27.5
HNRNPMP52272 SIL1-204ENST00000503732 690 ntTSL 323.07■■□□□ 1.283e-7■■■■■ 27.5
HNRNPMP52272 ACER3-205ENST00000526597 1269 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.881e-6■■■■■ 27.5
HNRNPMP52272 ACER3-201ENST00000278544 3500 ntTSL 1 (best)19.84■□□□□ 0.771e-6■■■■■ 27.5
HNRNPMP52272 SIL1-208ENST00000505945 250 ntTSL 1 (best)18.38■□□□□ 0.533e-7■■■■■ 27.5
HNRNPMP52272 ACER3-210ENST00000531352 2093 ntTSL 1 (best)18.22■□□□□ 0.511e-6■■■■■ 27.5
HNRNPMP52272 ACER3-212ENST00000532485 7378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.511e-6■■■■■ 27.5
HNRNPMP52272 ACER3-213ENST00000533873 929 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.691e-6■■■■■ 27.5
HNRNPMP52272 ACER3-208ENST00000530334 931 ntTSL 29.5□□□□□ -0.891e-6■■■■■ 27.5
HNRNPMP52272 ACER3-206ENST00000527508 531 ntTSL 23.95□□□□□ -1.781e-6■■■■■ 27.5
HNRNPMP52272 UBN1-207ENST00000589191 705 ntTSL 327.49■■□□□ 1.993e-6■■■■■ 27.5
HNRNPMP52272 XXYLT1-211ENST00000494175 565 ntTSL 429.05■■■□□ 2.246e-8■■■■■ 27.5
HNRNPMP52272 ASGR2-206ENST00000576487 1055 ntTSL 1 (best)24.34■■□□□ 1.493e-15■■■■■ 27.5
HNRNPMP52272 ASGR2-205ENST00000574868 1202 ntTSL 523.21■■□□□ 1.313e-15■■■■■ 27.5
HNRNPMP52272 ASGR2-204ENST00000450034 932 ntTSL 222■■□□□ 1.113e-15■■■■■ 27.5
HNRNPMP52272 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.093e-15■■■■■ 27.5
HNRNPMP52272 ASGR2-201ENST00000254850 1396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.763e-15■■■■■ 27.5
HNRNPMP52272 ASGR2-202ENST00000355035 1386 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.763e-15■■■■■ 27.5
HNRNPMP52272 PPP6R1-204ENST00000587457 2389 ntTSL 221.97■■□□□ 1.113e-7■■■■■ 27.5
HNRNPMP52272 RBM12-204ENST00000424458 1068 ntTSL 239.52■■■■□ 3.926e-8■■■■■ 27.5
HNRNPMP52272 CPNE1-223ENST00000475146 627 ntTSL 337.85■■■■□ 3.656e-8■■■■■ 27.5
HNRNPMP52272 RBM12-206ENST00000435161 565 ntTSL 418.15■□□□□ 0.56e-8■■■■■ 27.5
HNRNPMP52272 RBM12-205ENST00000431148 583 ntTSL 417.66■□□□□ 0.426e-8■■■■■ 27.5
HNRNPMP52272 SNHG14-217ENST00000552781 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.669e-7■■■■■ 27.5
HNRNPMP52272 DLEU1-227ENST00000484869 1652 ntTSL 514.21□□□□□ -0.133e-7■■■■■ 27.5
HNRNPMP52272 DLEU1-214ENST00000470726 508 ntTSL 512.59□□□□□ -0.393e-7■■■■■ 27.5
HNRNPMP52272 DLEU1-221ENST00000479420 612 ntTSL 59.29□□□□□ -0.923e-7■■■■■ 27.5
HNRNPMP52272 MGC4859-201ENST00000634803 3118 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.732e-6■■■■■ 27.5
HNRNPMP52272 EHMT1-248ENST00000637891 1930 ntTSL 523.12■■□□□ 1.297e-7■■■■■ 27.5
HNRNPMP52272 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.061e-7■■■■■ 27.5
HNRNPMP52272 NSD2-220ENST00000509115 1212 ntTSL 219.01■□□□□ 0.631e-7■■■■■ 27.5
HNRNPMP52272 NSD2-222ENST00000512700 1095 ntTSL 519.01■□□□□ 0.631e-7■■■■■ 27.5
HNRNPMP52272 ASS1-205ENST00000422569 807 ntTSL 533.84■■■■□ 3.012e-6■■■■■ 27.5
HNRNPMP52272 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.42e-6■■■■■ 27.5
HNRNPMP52272 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.782e-6■■■■■ 27.5
HNRNPMP52272 ASS1-201ENST00000352480 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.572e-6■■■■■ 27.5
HNRNPMP52272 ZNF407-207ENST00000582337 5662 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.791e-6■■■■■ 27.5
HNRNPMP52272 ZNF407-202ENST00000309902 5595 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.871e-6■■■■■ 27.5
HNRNPMP52272 SLC38A10-209ENST00000546352 580 ntTSL 517.59■□□□□ 0.412e-6■■■■■ 27.5
HNRNPMP52272 NOB1-206ENST00000569871 845 ntTSL 526.13■■□□□ 1.771e-6■■■■■ 27.5
HNRNPMP52272 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.771e-6■■■■■ 27.5
HNRNPMP52272 PDIA5-205ENST00000484644 667 ntTSL 536.76■■■■□ 3.486e-8■■■■■ 27.5
HNRNPMP52272 CMIP-202ENST00000537098 4357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.573e-7■■■■■ 27.4
HNRNPMP52272 CBFB-205ENST00000564034 509 ntTSL 236.56■■■■□ 3.444e-8■■■■■ 27.4
HNRNPMP52272 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.696e-9■■■■■ 27.4
HNRNPMP52272 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.54e-8■■■■■ 27.4
HNRNPMP52272 CBFB-204ENST00000563939 545 ntTSL 430.32■■■□□ 2.444e-8■■■■■ 27.4
HNRNPMP52272 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.494e-8■■■■■ 27.4
HNRNPMP52272 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.244e-8■■■■■ 27.4
HNRNPMP52272 RNF4-213ENST00000509388 569 ntTSL 322.69■■□□□ 1.226e-9■■■■■ 27.4
HNRNPMP52272 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.194e-8■■■■■ 27.4
HNRNPMP52272 RNF4-202ENST00000502316 855 ntTSL 221.93■■□□□ 1.16e-9■■■■■ 27.4
HNRNPMP52272 RNF4-208ENST00000507247 616 ntTSL 1 (best)21.63■■□□□ 1.056e-9■■■■■ 27.4
HNRNPMP52272 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.044e-8■■■■■ 27.4
HNRNPMP52272 RNF4-215ENST00000511843 586 ntTSL 521.09■□□□□ 0.976e-9■■■■■ 27.4
Retrieved 100 of 21,363 protein–RNA pairs in 151.7 ms