Protein–RNA interactions for Protein: P42765

ACAA2, 3-ketoacyl-CoA thiolase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA2P42765 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ACAA2P42765 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ACAA2P42765 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ACAA2P42765 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ACAA2P42765 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ACAA2P42765 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ACAA2P42765 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ACAA2P42765 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ACAA2P42765 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ACAA2P42765 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACAA2P42765 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACAA2P42765 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACAA2P42765 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACAA2P42765 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACAA2P42765 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACAA2P42765 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACAA2P42765 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACAA2P42765 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACAA2P42765 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACAA2P42765 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACAA2P42765 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACAA2P42765 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACAA2P42765 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACAA2P42765 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACAA2P42765 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACAA2P42765 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACAA2P42765 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACAA2P42765 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACAA2P42765 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACAA2P42765 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACAA2P42765 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACAA2P42765 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACAA2P42765 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACAA2P42765 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACAA2P42765 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACAA2P42765 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACAA2P42765 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ACAA2P42765 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACAA2P42765 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACAA2P42765 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACAA2P42765 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACAA2P42765 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACAA2P42765 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACAA2P42765 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACAA2P42765 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACAA2P42765 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ACAA2P42765 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ACAA2P42765 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ACAA2P42765 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ACAA2P42765 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ACAA2P42765 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ACAA2P42765 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ACAA2P42765 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ACAA2P42765 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ACAA2P42765 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ACAA2P42765 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ACAA2P42765 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ACAA2P42765 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ACAA2P42765 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ACAA2P42765 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ACAA2P42765 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ACAA2P42765 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ACAA2P42765 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACAA2P42765 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACAA2P42765 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACAA2P42765 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACAA2P42765 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACAA2P42765 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACAA2P42765 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACAA2P42765 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACAA2P42765 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACAA2P42765 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACAA2P42765 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACAA2P42765 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACAA2P42765 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACAA2P42765 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACAA2P42765 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACAA2P42765 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACAA2P42765 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACAA2P42765 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACAA2P42765 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACAA2P42765 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACAA2P42765 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACAA2P42765 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACAA2P42765 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACAA2P42765 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACAA2P42765 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACAA2P42765 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACAA2P42765 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACAA2P42765 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACAA2P42765 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACAA2P42765 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACAA2P42765 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACAA2P42765 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACAA2P42765 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACAA2P42765 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACAA2P42765 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ACAA2P42765 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACAA2P42765 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACAA2P42765 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms