Protein–RNA interactions for Protein: P34932

HSPA4, Heat shock 70 kDa protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA4P34932 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
HSPA4P34932 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HSPA4P34932 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HSPA4P34932 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HSPA4P34932 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HSPA4P34932 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HSPA4P34932 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HSPA4P34932 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HSPA4P34932 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HSPA4P34932 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HSPA4P34932 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HSPA4P34932 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HSPA4P34932 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HSPA4P34932 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HSPA4P34932 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
HSPA4P34932 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HSPA4P34932 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HSPA4P34932 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HSPA4P34932 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HSPA4P34932 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HSPA4P34932 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
HSPA4P34932 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HSPA4P34932 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HSPA4P34932 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HSPA4P34932 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HSPA4P34932 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HSPA4P34932 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HSPA4P34932 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HSPA4P34932 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HSPA4P34932 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
HSPA4P34932 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HSPA4P34932 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HSPA4P34932 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HSPA4P34932 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
HSPA4P34932 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HSPA4P34932 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HSPA4P34932 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HSPA4P34932 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HSPA4P34932 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HSPA4P34932 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HSPA4P34932 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HSPA4P34932 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HSPA4P34932 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HSPA4P34932 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HSPA4P34932 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HSPA4P34932 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HSPA4P34932 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HSPA4P34932 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HSPA4P34932 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HSPA4P34932 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HSPA4P34932 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HSPA4P34932 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HSPA4P34932 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HSPA4P34932 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HSPA4P34932 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HSPA4P34932 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HSPA4P34932 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HSPA4P34932 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HSPA4P34932 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HSPA4P34932 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HSPA4P34932 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HSPA4P34932 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HSPA4P34932 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HSPA4P34932 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HSPA4P34932 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HSPA4P34932 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HSPA4P34932 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HSPA4P34932 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HSPA4P34932 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HSPA4P34932 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HSPA4P34932 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HSPA4P34932 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HSPA4P34932 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
HSPA4P34932 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HSPA4P34932 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HSPA4P34932 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HSPA4P34932 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
HSPA4P34932 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HSPA4P34932 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HSPA4P34932 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HSPA4P34932 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HSPA4P34932 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HSPA4P34932 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HSPA4P34932 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HSPA4P34932 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HSPA4P34932 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HSPA4P34932 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HSPA4P34932 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HSPA4P34932 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HSPA4P34932 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HSPA4P34932 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HSPA4P34932 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HSPA4P34932 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HSPA4P34932 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HSPA4P34932 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HSPA4P34932 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HSPA4P34932 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HSPA4P34932 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HSPA4P34932 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HSPA4P34932 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms