Protein–RNA interactions for Protein: P28288

ABCD3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD3P28288 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ABCD3P28288 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ABCD3P28288 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ABCD3P28288 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ABCD3P28288 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ABCD3P28288 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ABCD3P28288 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ABCD3P28288 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ABCD3P28288 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ABCD3P28288 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ABCD3P28288 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ABCD3P28288 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ABCD3P28288 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ABCD3P28288 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ABCD3P28288 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ABCD3P28288 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ABCD3P28288 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ABCD3P28288 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ABCD3P28288 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ABCD3P28288 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ABCD3P28288 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ABCD3P28288 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ABCD3P28288 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ABCD3P28288 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ABCD3P28288 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ABCD3P28288 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ABCD3P28288 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ABCD3P28288 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ABCD3P28288 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ABCD3P28288 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ABCD3P28288 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ABCD3P28288 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ABCD3P28288 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ABCD3P28288 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ABCD3P28288 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ABCD3P28288 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ABCD3P28288 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ABCD3P28288 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ABCD3P28288 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ABCD3P28288 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ABCD3P28288 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ABCD3P28288 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ABCD3P28288 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ABCD3P28288 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ABCD3P28288 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ABCD3P28288 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ABCD3P28288 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ABCD3P28288 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ABCD3P28288 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ABCD3P28288 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ABCD3P28288 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ABCD3P28288 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ABCD3P28288 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ABCD3P28288 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ABCD3P28288 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ABCD3P28288 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ABCD3P28288 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ABCD3P28288 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ABCD3P28288 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ABCD3P28288 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ABCD3P28288 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ABCD3P28288 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ABCD3P28288 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ABCD3P28288 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ABCD3P28288 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ABCD3P28288 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ABCD3P28288 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ABCD3P28288 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ABCD3P28288 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ABCD3P28288 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ABCD3P28288 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ABCD3P28288 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ABCD3P28288 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ABCD3P28288 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ABCD3P28288 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ABCD3P28288 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ABCD3P28288 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ABCD3P28288 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ABCD3P28288 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ABCD3P28288 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ABCD3P28288 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ABCD3P28288 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ABCD3P28288 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ABCD3P28288 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ABCD3P28288 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ABCD3P28288 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ABCD3P28288 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ABCD3P28288 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ABCD3P28288 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ABCD3P28288 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ABCD3P28288 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ABCD3P28288 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ABCD3P28288 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ABCD3P28288 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ABCD3P28288 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ABCD3P28288 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABCD3P28288 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABCD3P28288 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABCD3P28288 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABCD3P28288 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms