Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMB4P28070 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMB4P28070 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMB4P28070 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMB4P28070 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMB4P28070 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMB4P28070 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMB4P28070 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMB4P28070 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMB4P28070 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMB4P28070 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMB4P28070 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMB4P28070 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMB4P28070 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMB4P28070 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMB4P28070 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMB4P28070 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMB4P28070 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMB4P28070 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMB4P28070 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMB4P28070 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMB4P28070 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMB4P28070 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMB4P28070 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMB4P28070 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMB4P28070 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMB4P28070 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMB4P28070 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMB4P28070 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMB4P28070 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMB4P28070 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMB4P28070 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMB4P28070 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMB4P28070 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMB4P28070 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMB4P28070 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMB4P28070 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMB4P28070 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMB4P28070 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMB4P28070 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMB4P28070 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMB4P28070 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMB4P28070 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PSMB4P28070 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PSMB4P28070 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PSMB4P28070 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMB4P28070 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMB4P28070 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMB4P28070 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMB4P28070 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMB4P28070 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMB4P28070 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMB4P28070 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMB4P28070 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMB4P28070 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMB4P28070 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMB4P28070 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMB4P28070 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMB4P28070 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMB4P28070 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMB4P28070 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMB4P28070 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMB4P28070 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMB4P28070 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMB4P28070 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMB4P28070 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMB4P28070 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMB4P28070 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMB4P28070 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMB4P28070 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMB4P28070 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMB4P28070 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMB4P28070 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMB4P28070 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMB4P28070 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMB4P28070 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMB4P28070 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMB4P28070 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMB4P28070 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMB4P28070 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMB4P28070 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMB4P28070 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMB4P28070 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMB4P28070 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMB4P28070 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMB4P28070 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMB4P28070 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMB4P28070 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMB4P28070 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMB4P28070 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMB4P28070 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMB4P28070 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMB4P28070 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMB4P28070 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMB4P28070 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMB4P28070 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMB4P28070 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMB4P28070 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMB4P28070 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMB4P28070 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms